27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0852 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0852  hypothetical protein  100 
 
 
828 aa  1353    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3941  hypothetical protein  67.23 
 
 
941 aa  680    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725312  normal  0.0191769 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0369  hypothetical protein  99.04 
 
 
991 aa  970    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0823  hypothetical protein  69.3 
 
 
913 aa  770    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160742  hitchhiker  0.00320377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2536  hypothetical protein  48.38 
 
 
1860 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.116174 
 
 
-
 
NC_003296  RS01904  signal peptide protein  46.35 
 
 
667 aa  337  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.187558 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3158  hypothetical protein  32.95 
 
 
689 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393526  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1866  hypothetical protein  32.62 
 
 
668 aa  118  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2740  hypothetical protein  32.62 
 
 
668 aa  118  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.317986  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3178  hypothetical protein  33.23 
 
 
628 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110039  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1438  hypothetical protein  34.26 
 
 
460 aa  99.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3121  hypothetical protein  31.65 
 
 
497 aa  95.1  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.320306  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  36.43 
 
 
519 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  36.43 
 
 
516 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1489  hypothetical protein  36.43 
 
 
517 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3649  hemagglutinin-related transmembrane protein  42.08 
 
 
527 aa  75.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1761  hypothetical protein  37.05 
 
 
534 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1783  hypothetical protein  37.02 
 
 
533 aa  71.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1936  hypothetical protein  35.42 
 
 
635 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128348  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0908  hypothetical protein  35.1 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1438  hypothetical protein  38.54 
 
 
501 aa  52.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745674  normal  0.0926543 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1398  hypothetical protein  46.94 
 
 
527 aa  52  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1495  hypothetical protein  24.34 
 
 
10624 aa  50.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1524  hypothetical protein  24.34 
 
 
10624 aa  50.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6354  hypothetical protein  35.16 
 
 
1166 aa  45.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00361668  normal  0.829554 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2630  putative hemagglutinin-related transmembrane protein  60 
 
 
385 aa  45.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2548  hypothetical protein  33.92 
 
 
535 aa  44.7  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>