63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2056 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2056  protein of unknown function DUF952  100 
 
 
502 aa  957    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0199379  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1827  hypothetical protein  65.04 
 
 
361 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5863  hypothetical protein  62.89 
 
 
366 aa  412  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210908  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18570  hypothetical protein  64.49 
 
 
396 aa  395  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.000320987  normal  0.0615594 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1772  hypothetical protein  69.84 
 
 
334 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1784  hypothetical protein  63.93 
 
 
388 aa  395  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000515707  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2433  hypothetical protein  60.42 
 
 
353 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.657563  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2315  hypothetical protein  65.83 
 
 
352 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000142182  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1865  protein of unknown function DUF952  67.54 
 
 
387 aa  381  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00749947  normal  0.185067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1500  hypothetical protein  61.1 
 
 
371 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.472105  hitchhiker  0.000928379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2248  hypothetical protein  63.2 
 
 
374 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.147862  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2366  hypothetical protein  61.68 
 
 
361 aa  351  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.646563  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4457  hypothetical protein  55.01 
 
 
373 aa  347  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375251  normal  0.0701737 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1286  hypothetical protein  52.73 
 
 
374 aa  342  8e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2685  hypothetical protein  58.22 
 
 
353 aa  336  5.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1878  hypothetical protein  65.31 
 
 
363 aa  335  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16050  hypothetical protein  48.46 
 
 
371 aa  297  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1093  hypothetical protein  42.9 
 
 
361 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0349862  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1323  hypothetical protein  51.5 
 
 
365 aa  252  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1285  hypothetical protein  48.97 
 
 
367 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.099522  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0596  hypothetical protein  42.68 
 
 
359 aa  242  9e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2047  hypothetical protein  40.46 
 
 
360 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06820  hypothetical protein  39.88 
 
 
364 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1551  hypothetical protein  35.8 
 
 
358 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.804508  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1674  hypothetical protein  35.09 
 
 
372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455144 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1341  hypothetical protein  27.05 
 
 
350 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000130295  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1446  hypothetical protein  38.99 
 
 
337 aa  123  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0376181  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3088  hypothetical protein  35.62 
 
 
341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.28 
 
 
323 aa  91.3  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1680  protein of unknown function DUF952  50.98 
 
 
103 aa  90.5  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569653  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.4 
 
 
323 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4589  protein of unknown function DUF952  42.57 
 
 
114 aa  77  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  hitchhiker  0.00537497 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02570  hypothetical protein  43.12 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.498225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2243  protein of unknown function DUF952  42.39 
 
 
108 aa  74.3  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0928716  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3943  hypothetical protein  42.86 
 
 
125 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00940  hypothetical protein  44.9 
 
 
117 aa  67  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2172  hypothetical protein  39.39 
 
 
117 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3543  protein of unknown function DUF952  32.38 
 
 
120 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2563  protein of unknown function DUF952  32.38 
 
 
120 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4927  protein of unknown function DUF952  40 
 
 
107 aa  63.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  30.69 
 
 
333 aa  63.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12470  hypothetical protein  35 
 
 
121 aa  62.4  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144496  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2456  hypothetical protein  41.24 
 
 
118 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2171  hypothetical protein  37.5 
 
 
142 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0419076  hitchhiker  0.00150651 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1633  protein of unknown function DUF952  35.05 
 
 
120 aa  58.9  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0372909 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2228  hypothetical protein  37.5 
 
 
142 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2182  hypothetical protein  37.5 
 
 
142 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0952783  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12720  hypothetical protein  34.91 
 
 
129 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3797  protein of unknown function DUF952  37.14 
 
 
128 aa  53.5  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.899474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5199  protein of unknown function DUF952  29.29 
 
 
98 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157492  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0513  hypothetical protein  34.58 
 
 
121 aa  53.5  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11264  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1066  protein of unknown function DUF952  29.36 
 
 
116 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.210696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2970  hypothetical protein  34.02 
 
 
111 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1916  hypothetical protein  30.43 
 
 
114 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3672  hypothetical protein  28 
 
 
115 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0080  protein of unknown function DUF952  38.89 
 
 
108 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0585  hypothetical protein  38.46 
 
 
143 aa  48.5  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3986  protein of unknown function DUF952  35.71 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4536  protein of unknown function DUF952  37 
 
 
115 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0517  hypothetical protein  32.71 
 
 
119 aa  45.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2860  hypothetical protein  26.37 
 
 
106 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000466115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0221  protein of unknown function DUF952  32.04 
 
 
117 aa  43.9  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1163  hypothetical protein  36.9 
 
 
103 aa  43.5  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0556708  normal  0.177058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>