28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1865 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1865  protein of unknown function DUF952  100 
 
 
387 aa  735    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00749947  normal  0.185067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2056  protein of unknown function DUF952  67.67 
 
 
502 aa  410  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0199379  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1827  hypothetical protein  62.37 
 
 
361 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18570  hypothetical protein  61.81 
 
 
396 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.000320987  normal  0.0615594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5863  hypothetical protein  61.38 
 
 
366 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210908  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1784  hypothetical protein  59.68 
 
 
388 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000515707  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1286  hypothetical protein  57.06 
 
 
374 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2433  hypothetical protein  60.16 
 
 
353 aa  362  5.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.657563  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2315  hypothetical protein  60.76 
 
 
352 aa  359  4e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000142182  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1500  hypothetical protein  58.49 
 
 
371 aa  358  7e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.472105  hitchhiker  0.000928379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1772  hypothetical protein  64.79 
 
 
334 aa  358  8e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2248  hypothetical protein  60.74 
 
 
374 aa  349  6e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.147862  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4457  hypothetical protein  56.35 
 
 
373 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375251  normal  0.0701737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2366  hypothetical protein  60.65 
 
 
361 aa  346  3e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.646563  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1878  hypothetical protein  66.31 
 
 
363 aa  332  5e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2685  hypothetical protein  55.18 
 
 
353 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16050  hypothetical protein  49.35 
 
 
371 aa  306  6e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1093  hypothetical protein  41.05 
 
 
361 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0349862  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0596  hypothetical protein  40.69 
 
 
359 aa  257  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1285  hypothetical protein  44.53 
 
 
367 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.099522  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1323  hypothetical protein  45.69 
 
 
365 aa  246  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2047  hypothetical protein  38.27 
 
 
360 aa  246  6e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1551  hypothetical protein  33.95 
 
 
358 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.804508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06820  hypothetical protein  37.25 
 
 
364 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1674  hypothetical protein  34.15 
 
 
372 aa  171  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455144 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1341  hypothetical protein  26.6 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000130295  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1446  hypothetical protein  37.61 
 
 
337 aa  123  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0376181  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3088  hypothetical protein  33.42 
 
 
341 aa  99.8  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>