28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1093 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1093  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  736    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0349862  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2047  hypothetical protein  58.31 
 
 
360 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1285  hypothetical protein  56.57 
 
 
367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.099522  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0596  hypothetical protein  48.55 
 
 
359 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1323  hypothetical protein  50.58 
 
 
365 aa  343  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1551  hypothetical protein  47.63 
 
 
358 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.804508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06820  hypothetical protein  44.48 
 
 
364 aa  277  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5863  hypothetical protein  40.96 
 
 
366 aa  262  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210908  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1827  hypothetical protein  41.04 
 
 
361 aa  256  6e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2433  hypothetical protein  41.48 
 
 
353 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.657563  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1674  hypothetical protein  41.14 
 
 
372 aa  252  6e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4457  hypothetical protein  39.78 
 
 
373 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375251  normal  0.0701737 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1500  hypothetical protein  38.2 
 
 
371 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.472105  hitchhiker  0.000928379 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1286  hypothetical protein  40.17 
 
 
374 aa  246  3e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1772  hypothetical protein  41.82 
 
 
334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2315  hypothetical protein  40.57 
 
 
352 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000142182  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2685  hypothetical protein  42.51 
 
 
353 aa  237  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18570  hypothetical protein  40.42 
 
 
396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.000320987  normal  0.0615594 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1865  protein of unknown function DUF952  39.18 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00749947  normal  0.185067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2056  protein of unknown function DUF952  42.54 
 
 
502 aa  229  8e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0199379  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2248  hypothetical protein  38.64 
 
 
374 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.147862  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2366  hypothetical protein  38.26 
 
 
361 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.646563  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1784  hypothetical protein  37.38 
 
 
388 aa  219  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000515707  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1878  hypothetical protein  40.88 
 
 
363 aa  212  9e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16050  hypothetical protein  35.25 
 
 
371 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1341  hypothetical protein  33.15 
 
 
350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000130295  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1446  hypothetical protein  35.65 
 
 
337 aa  163  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0376181  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3088  hypothetical protein  34.45 
 
 
341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>