28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0596 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0596  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  727    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1093  hypothetical protein  49.14 
 
 
361 aa  364  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0349862  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1285  hypothetical protein  48.87 
 
 
367 aa  335  7e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.099522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2047  hypothetical protein  46.94 
 
 
360 aa  318  9e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1551  hypothetical protein  44.7 
 
 
358 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.804508  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1323  hypothetical protein  50 
 
 
365 aa  315  9e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1827  hypothetical protein  42.24 
 
 
361 aa  272  6e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1772  hypothetical protein  45.34 
 
 
334 aa  270  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5863  hypothetical protein  43.1 
 
 
366 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.210908  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1500  hypothetical protein  45.02 
 
 
371 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.472105  hitchhiker  0.000928379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2433  hypothetical protein  45.51 
 
 
353 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.657563  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06820  hypothetical protein  41.98 
 
 
364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2315  hypothetical protein  43.33 
 
 
352 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000142182  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1674  hypothetical protein  37.87 
 
 
372 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4457  hypothetical protein  40.61 
 
 
373 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.375251  normal  0.0701737 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2248  hypothetical protein  42.94 
 
 
374 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.147862  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18570  hypothetical protein  42.94 
 
 
396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.000320987  normal  0.0615594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2685  hypothetical protein  43.03 
 
 
353 aa  243  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1286  hypothetical protein  39.88 
 
 
374 aa  242  6e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1784  hypothetical protein  42.19 
 
 
388 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  unclonable  0.000000000515707  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2366  hypothetical protein  42.81 
 
 
361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.646563  normal  0.0182356 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1865  protein of unknown function DUF952  40.81 
 
 
387 aa  232  7.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00749947  normal  0.185067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2056  protein of unknown function DUF952  42.9 
 
 
502 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0199379  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1878  hypothetical protein  43.4 
 
 
363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16050  hypothetical protein  35.41 
 
 
371 aa  210  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1341  hypothetical protein  36.06 
 
 
350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000130295  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1446  hypothetical protein  36.36 
 
 
337 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0376181  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3088  hypothetical protein  35.69 
 
 
341 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>