40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12470 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12470  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  239  6e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144496  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1680  protein of unknown function DUF952  43.56 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569653  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.39 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.39 
 
 		 323 aa  71.2  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2243  protein of unknown function DUF952  43.48 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0928716  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4589  protein of unknown function DUF952  42.06 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  hitchhiker  0.00537497 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1633  protein of unknown function DUF952  38.3 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0372909 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4927  protein of unknown function DUF952  39.62 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3986  protein of unknown function DUF952  41.75 
 
 		 374 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3543  protein of unknown function DUF952  33.62 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2563  protein of unknown function DUF952  33.62 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2172  hypothetical protein  39.6 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5199  protein of unknown function DUF952  30.77 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0513  hypothetical protein  35.24 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11264  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2970  hypothetical protein  35.92 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  30.3 
 
 		 333 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3943  hypothetical protein  38 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2456  hypothetical protein  36.89 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2182  hypothetical protein  36.79 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0952783  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2171  hypothetical protein  36.79 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0419076  hitchhiker  0.00150651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2228  hypothetical protein  36.79 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1916  hypothetical protein  38.46 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02570  hypothetical protein  41.49 
 
 		 330 aa  55.1  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.498225  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1066  protein of unknown function DUF952  33.02 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.210696 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3672  hypothetical protein  36.27 
 
 		 115 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2056  protein of unknown function DUF952  35 
 
 		 502 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0199379  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2838  hypothetical protein  32.97 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000244787  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00940  hypothetical protein  34.62 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2472  hypothetical protein  29.81 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0467967  normal  0.531693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0548  hypothetical protein  31.37 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303281  normal  0.0576469 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2614  hypothetical protein  32.97 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0019859  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0861  hypothetical protein  32 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0405  hypothetical protein  26.85 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4536  protein of unknown function DUF952  33.66 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12720  hypothetical protein  31.37 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4550  hypothetical protein  30.97 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0326  hypothetical protein  28.7 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2860  hypothetical protein  28.3 
 
 		 106 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000466115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0312  hypothetical protein  28.7 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2059  protein of unknown function DUF952  32 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>