55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4927 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4927  protein of unknown function DUF952  100 
 
 
107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1680  protein of unknown function DUF952  51.46 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569653  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4589  protein of unknown function DUF952  51.02 
 
 
114 aa  78.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  hitchhiker  0.00537497 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  39 
 
 
323 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12470  hypothetical protein  39.62 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.144496  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.21 
 
 
323 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0513  hypothetical protein  38.46 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11264  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2243  protein of unknown function DUF952  45.56 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0928716  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5199  protein of unknown function DUF952  33.96 
 
 
98 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157492  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1916  hypothetical protein  34.31 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4550  hypothetical protein  39.62 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2056  protein of unknown function DUF952  36.61 
 
 
502 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0199379  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0102  hypothetical protein  36.79 
 
 
115 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3672  hypothetical protein  35.29 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2970  hypothetical protein  35.64 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2860  hypothetical protein  33.01 
 
 
106 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000466115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2838  hypothetical protein  33 
 
 
107 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000244787  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0080  protein of unknown function DUF952  39.05 
 
 
108 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12720  hypothetical protein  40.2 
 
 
129 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3543  protein of unknown function DUF952  31.53 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1067  hypothetical protein  33.02 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4623  hypothetical protein  36.45 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0548  hypothetical protein  34.95 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303281  normal  0.0576469 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3797  protein of unknown function DUF952  34.91 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.899474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2563  protein of unknown function DUF952  30.63 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1066  protein of unknown function DUF952  28.3 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.210696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2472  hypothetical protein  32 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0467967  normal  0.531693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2172  hypothetical protein  37.5 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4808  protein of unknown function DUF985  30.36 
 
 
286 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00940  hypothetical protein  40.19 
 
 
117 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  34.02 
 
 
333 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1468  hypothetical protein  30.69 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0787  hypothetical protein  32.69 
 
 
114 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.732307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0864  protein of unknown function DUF952  32.71 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2622  hypothetical protein  29.13 
 
 
112 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0382701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2820  hypothetical protein  30.77 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000165343 
 
 
-
 
NC_004310  BR0312  hypothetical protein  34.62 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2571  hypothetical protein  29.13 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000205599  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2538  hypothetical protein  30.1 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.070285  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2813  hypothetical protein  30.77 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0272117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2228  hypothetical protein  37.14 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2182  hypothetical protein  37.14 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0952783  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1633  protein of unknown function DUF952  33.65 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0372909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2171  hypothetical protein  37.14 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0419076  hitchhiker  0.00150651 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0326  hypothetical protein  31.07 
 
 
117 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3986  protein of unknown function DUF952  34.86 
 
 
374 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0387  hypothetical protein  32.08 
 
 
114 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.580664  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4536  protein of unknown function DUF952  34.95 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0956  hypothetical protein  33.65 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2383  protein of unknown function DUF952  33.98 
 
 
116 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0756  hypothetical protein  29.81 
 
 
114 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824326  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2059  protein of unknown function DUF952  33 
 
 
116 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2616  hypothetical protein  32.69 
 
 
112 aa  40.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3013  hypothetical protein  32.04 
 
 
112 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2614  hypothetical protein  25.23 
 
 
110 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0019859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>