79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2103 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2103  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  206  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1973  hypothetical protein  98 
 
 		 100 aa  201  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2067  hypothetical protein  83.51 
 
 		 99 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6010  hypothetical protein  83.51 
 
 		 99 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17376  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2086  hypothetical protein  83.51 
 
 		 99 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0273  hypothetical protein  53.49 
 
 		 169 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4627  hypothetical protein  45.88 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3741  hypothetical protein  45.88 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5677  hypothetical protein  45.88 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780825 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1843  hypothetical protein  34.25 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0489  hypothetical protein  41.67 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1954  hypothetical protein  34.25 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0686  hypothetical protein  34.25 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0982  hypothetical protein  34.25 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0855  hypothetical protein  34.25 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936199  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0765  hypothetical protein  34.25 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0495  hypothetical protein  34.25 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2133  hypothetical protein  34.25 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198683  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4028  hypothetical protein  43.75 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2375  hypothetical protein  37.84 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1362  hypothetical protein  52.63 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4974  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4454  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3321  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0617  hypothetical protein  50 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5238  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5046  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.395573  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4159  hypothetical protein  51.22 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.429697  normal  0.176279 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0871  hypothetical protein  47.17 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1113  hypothetical protein  47.17 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.281581  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4105  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1027  hypothetical protein  47.17 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1838  hypothetical protein  47.17 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.359362  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0598  hypothetical protein  47.17 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3924  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2330  hypothetical protein  47.17 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4215  hypothetical protein  46.94 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3593  hypothetical protein  47.37 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3880  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4489  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5270  hypothetical protein  36.36 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.836631  normal  0.0612346 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5815  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4388  hypothetical protein  46.51 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418441  normal  0.214663 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6430  hypothetical protein  37.8 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.382018 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4284  hypothetical protein  44.64 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.271599 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1644  hypothetical protein  51.28 
 
 		 203 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.653964  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3741  hypothetical protein  46.94 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.770461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3630  hypothetical protein  29.55 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000854481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4332  hypothetical protein  45.28 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.571244  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6994  hypothetical protein  40.48 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0489051 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4326  hypothetical protein  39.66 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4040  hypothetical protein  39.66 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.427751  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  35.29 
 
 		 116 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0102  hypothetical protein  46 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17256  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0810  hypothetical protein  40.32 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.298574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5035  hypothetical protein  39.34 
 
 		 105 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256648  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4973  hypothetical protein  39.13 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.53439  normal  0.116031 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4392  hypothetical protein  44 
 
 		 94 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4149  hypothetical protein  32.26 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0557  hypothetical protein  32.26 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1036  hypothetical protein  32.26 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1633  hypothetical protein  32.5 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4029  hypothetical protein  34.33 
 
 		 112 aa  40.8  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.36674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  37.78 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  37.78 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  37.78 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1680  hypothetical protein  48.72 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305616  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1500  hypothetical protein  38.1 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6524  hypothetical protein  40.48 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6329  hypothetical protein  38.1 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366732  normal  0.8454 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5847  hypothetical protein  45.65 
 
 		 202 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0169933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3447  hypothetical protein  41.46 
 
 		 113 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0395  hypothetical protein  38.3 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0830  hypothetical protein  38.18 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.308728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  35.09 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5267  hypothetical protein  41.46 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600229  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4880  hypothetical protein  48.72 
 
 		 108 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000209692  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1611  hypothetical protein  48.72 
 
 		 108 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6636  hypothetical protein  27.27 
 
 		 100 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.418268  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>