46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5035 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5035  hypothetical protein  100 
 
 
105 aa  203  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256648  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1622  hypothetical protein  82.86 
 
 
103 aa  141  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238782  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4029  hypothetical protein  68.92 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.36674  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0670  hypothetical protein  52.43 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4211  hypothetical protein  77.97 
 
 
104 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.609402 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5755  hypothetical protein  75 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.443915 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6524  hypothetical protein  53.75 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6197  hypothetical protein  75.61 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0469177 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5830  hypothetical protein  75.61 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6673  hypothetical protein  73.17 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.264254 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0694  hypothetical protein  39.78 
 
 
93 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317977  normal  0.650838 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5324  hypothetical protein  69.23 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807961  normal  0.0487892 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5999  hypothetical protein  73.53 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147694  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2123  hypothetical protein  38.64 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838813  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1546  hypothetical protein  61.11 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58247  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2103  hypothetical protein  32.95 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1633  hypothetical protein  46.43 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1610  hypothetical protein  49.12 
 
 
109 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1843  hypothetical protein  38.1 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4880  hypothetical protein  54.05 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000209692  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1700  hypothetical protein  55.56 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1673  hypothetical protein  55.56 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.214967  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6430  hypothetical protein  55.56 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.382018 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0489  hypothetical protein  45.45 
 
 
105 aa  42  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1221  hypothetical protein  55.56 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249228  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0495  hypothetical protein  36.51 
 
 
102 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2133  hypothetical protein  36.51 
 
 
102 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198683  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5749  hypothetical protein  51.43 
 
 
103 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518666  normal  0.911831 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1954  hypothetical protein  36.51 
 
 
102 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0855  hypothetical protein  36.51 
 
 
116 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936199  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0982  hypothetical protein  36.51 
 
 
116 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0686  hypothetical protein  36.51 
 
 
116 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0765  hypothetical protein  36.51 
 
 
102 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5993  hypothetical protein  51.43 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227911  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4879  hypothetical protein  52.78 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00122865  normal  0.244901 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6143  hypothetical protein  43.4 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0772787  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1611  hypothetical protein  52.78 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3880  hypothetical protein  48.57 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4489  hypothetical protein  48.57 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5815  hypothetical protein  48.57 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703977  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1973  hypothetical protein  40.38 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1634  hypothetical protein  52.78 
 
 
108 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1644  hypothetical protein  52.78 
 
 
203 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.653964  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4028  hypothetical protein  54.29 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2330  hypothetical protein  52.78 
 
 
172 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0598  hypothetical protein  52.78 
 
 
172 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>