61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5755 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5755  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  200  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.443915 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6524  hypothetical protein  83.96 
 
 
102 aa  120  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6673  hypothetical protein  85.29 
 
 
117 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.264254 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6197  hypothetical protein  85.58 
 
 
120 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0469177 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5830  hypothetical protein  85.58 
 
 
120 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4211  hypothetical protein  55.88 
 
 
104 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.609402 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5999  hypothetical protein  77.66 
 
 
108 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147694  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5324  hypothetical protein  79.25 
 
 
102 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807961  normal  0.0487892 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1622  hypothetical protein  74.14 
 
 
103 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238782  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5035  hypothetical protein  68.97 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256648  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4029  hypothetical protein  48.11 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.36674  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0670  hypothetical protein  48.11 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2123  hypothetical protein  43.88 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838813  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0694  hypothetical protein  53.19 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317977  normal  0.650838 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6994  hypothetical protein  40.91 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0489051 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6329  hypothetical protein  40.91 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366732  normal  0.8454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1500  hypothetical protein  40.91 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1610  hypothetical protein  53.49 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5866  hypothetical protein  47.73 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4880  hypothetical protein  52.63 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000209692  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  42.86 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0395  hypothetical protein  36.59 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.820635  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  45.24 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0617  hypothetical protein  42.86 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1025  hypothetical protein  45.24 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0462952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  45.24 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1633  hypothetical protein  52.38 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  45.24 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4124  hypothetical protein  42.86 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00630342  normal  0.0204698 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4973  hypothetical protein  44.19 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.53439  normal  0.116031 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1700  hypothetical protein  51.22 
 
 
109 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0489  hypothetical protein  39.22 
 
 
105 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4974  hypothetical protein  42.86 
 
 
100 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416203  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4454  hypothetical protein  42.86 
 
 
100 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1221  hypothetical protein  51.22 
 
 
109 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249228  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1673  hypothetical protein  50 
 
 
112 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.214967  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5749  hypothetical protein  44.9 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518666  normal  0.911831 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5993  hypothetical protein  44.9 
 
 
103 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227911  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1546  hypothetical protein  48.84 
 
 
110 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.58247  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6430  hypothetical protein  42.86 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.382018 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1843  hypothetical protein  44.19 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4512  hypothetical protein  45.45 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.874948  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5238  hypothetical protein  44.74 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3225  hypothetical protein  45.24 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0495  hypothetical protein  44.44 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2133  hypothetical protein  44.44 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198683  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2756  hypothetical protein  54.05 
 
 
116 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3321  hypothetical protein  44.74 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4935  hypothetical protein  45.24 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1954  hypothetical protein  44.44 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5046  hypothetical protein  44.74 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.395573  normal  0.543798 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0686  hypothetical protein  44.44 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0982  hypothetical protein  44.44 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0855  hypothetical protein  44.44 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936199  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0765  hypothetical protein  44.44 
 
 
102 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6208  hypothetical protein  41.82 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00163451 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5841  hypothetical protein  41.82 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.516639  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6611  hypothetical protein  42.31 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6684  hypothetical protein  41.82 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0468318  normal  0.226284 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1611  hypothetical protein  48.78 
 
 
108 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7213  hypothetical protein  38.78 
 
 
107 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>