54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0670 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0670  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  216  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4029  hypothetical protein  93.75 
 
 
112 aa  188  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.36674  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4211  hypothetical protein  62.04 
 
 
104 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.609402 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5035  hypothetical protein  69.57 
 
 
105 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256648  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1622  hypothetical protein  76.79 
 
 
103 aa  87  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238782  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6524  hypothetical protein  50.57 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0694  hypothetical protein  47.37 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.317977  normal  0.650838 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6197  hypothetical protein  64.58 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0469177 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5755  hypothetical protein  62.5 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.443915 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5830  hypothetical protein  64.58 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2123  hypothetical protein  47.76 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838813  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6673  hypothetical protein  62.5 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.264254 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5324  hypothetical protein  61.54 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807961  normal  0.0487892 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5999  hypothetical protein  61.76 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147694  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1843  hypothetical protein  54.29 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4733  hypothetical protein  51.43 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.013159  normal  0.0161997 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3634  hypothetical protein  51.43 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5549  hypothetical protein  51.43 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0495  hypothetical protein  51.43 
 
 
102 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1954  hypothetical protein  51.43 
 
 
102 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4028  hypothetical protein  57.14 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2133  hypothetical protein  51.43 
 
 
102 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.198683  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6994  hypothetical protein  33.68 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0489051 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7213  hypothetical protein  38.1 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0855  hypothetical protein  51.43 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936199  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0982  hypothetical protein  51.43 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0686  hypothetical protein  51.43 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0765  hypothetical protein  51.43 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6329  hypothetical protein  33.68 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.366732  normal  0.8454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1500  hypothetical protein  33.68 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0489  hypothetical protein  54.29 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0091  hypothetical protein  46.51 
 
 
86 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0617  hypothetical protein  47.22 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.546911  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4492  hypothetical protein  48.89 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4489  hypothetical protein  51.43 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3593  hypothetical protein  45.83 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3942  hypothetical protein  47.22 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.859145 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5749  hypothetical protein  48.57 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.518666  normal  0.911831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4588  hypothetical protein  45.71 
 
 
109 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0758849  hitchhiker  0.00165812 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3880  hypothetical protein  51.43 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5815  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.703977  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0810  hypothetical protein  48.84 
 
 
109 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.298574 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4974  hypothetical protein  48.57 
 
 
100 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.416203  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1673  hypothetical protein  44.07 
 
 
112 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.214967  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4454  hypothetical protein  48.57 
 
 
100 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5993  hypothetical protein  48.57 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227911  normal  0.658143 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5238  hypothetical protein  47.22 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4629  hypothetical protein  47.73 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1610  hypothetical protein  42.37 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4124  hypothetical protein  45.71 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00630342  normal  0.0204698 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3321  hypothetical protein  47.22 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1221  hypothetical protein  42.37 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1700  hypothetical protein  42.37 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5046  hypothetical protein  47.22 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.395573  normal  0.543798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>