62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1539 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1539  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  665    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1560  hypothetical protein  97.65 
 
 		 341 aa  607  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0159357  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4788  hypothetical protein  90.12 
 
 		 344 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1642  hypothetical protein  88.05 
 
 		 343 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118312  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1162  hypothetical protein  88.05 
 
 		 343 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1617  hypothetical protein  86.63 
 
 		 343 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00170035 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1596  hypothetical protein  81.82 
 
 		 338 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.91747  hitchhiker  0.00122514 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4037  hypothetical protein  45.71 
 
 		 341 aa  235  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3942  hypothetical protein  37.31 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2789  hypothetical protein  43.05 
 
 		 357 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.112907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3564  siderophore biosynthesis protein  36.69 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  44.67 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2862  hypothetical protein  36.9 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276239  normal  0.0557452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1682  hypothetical protein  39.11 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3811  siderophore biosynthesis protein  43.94 
 
 		 337 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25460  hypothetical protein  32.32 
 
 		 352 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2826  PvdYII  44.44 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3320  putative siderophore biosynthesis protein  35.86 
 
 		 380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0248153 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1092  putative acetylase  35.47 
 
 		 366 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474828 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5729  acetylase  37.24 
 
 		 349 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3727  hypothetical protein  39.09 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1824  hypothetical protein  36.1 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  37.69 
 
 		 400 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3739  hypothetical protein  34.69 
 
 		 344 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1543  hypothetical protein  34.47 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4806  N6-hydroxylysine O-acetyltransferase protein  36.71 
 
 		 343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1564  hypothetical protein  37.98 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31691  normal  0.229802 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4792  hypothetical protein  34.01 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0336601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1646  hypothetical protein  32.88 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1166  hypothetical protein  32.88 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1621  hypothetical protein  33.9 
 
 		 338 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185713 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1592  hypothetical protein  34.35 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260061  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  30.84 
 
 		 303 aa  135  9e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4035  hypothetical protein  37.11 
 
 		 316 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1346  hypothetical protein  37.68 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299655  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4633  N(6)-hydroxylysine O-acetyltransferase, aerobactin biosynthetic  34.25 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3181  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  33.94 
 
 		 315 aa  123  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0948  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  36.65 
 
 		 315 aa  123  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.633043  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10080  siderophore biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04450)  32.63 
 
 		 503 aa  122  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.277497  normal  0.331437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0785  putative siderophore biosynthesis protein IucB  33.21 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0713  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  32.48 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0191  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  32.48 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449097 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06234  siderophore biosynthesis acetylase AceI, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03400)  38.07 
 
 		 443 aa  116  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0685832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0921  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  32.35 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5061  hypothetical protein  35.26 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103312 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  27.15 
 
 		 925 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1813  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  29 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.419117  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00608  conserved hypothetical protein  31.63 
 
 		 443 aa  97.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3256  hypothetical protein  29.51 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  26.25 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  29.48 
 
 		 195 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4412  hypothetical protein  29.71 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.479008 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00758  conserved hypothetical protein  37.84 
 
 		 496 aa  56.6  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  27.42 
 
 		 842 aa  56.6  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1700  hypothetical protein  28.24 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1768  hypothetical protein  29.55 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1721  hypothetical protein  28.24 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880139  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  26.88 
 
 		 209 aa  53.5  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1943  hypothetical protein  28.89 
 
 		 199 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  30.63 
 
 		 225 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11377  hypothetical protein  26.11 
 
 		 210 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.512198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>