38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0645 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0645  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  294  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0668  hypothetical protein  97.26 
 
 		 146 aa  265  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3838  hypothetical protein  81.51 
 
 		 141 aa  237  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0720  hypothetical protein  75.66 
 
 		 152 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0751  hypothetical protein  76.87 
 
 		 147 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0267  hypothetical protein  76.87 
 
 		 147 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2634  hypothetical protein  89.09 
 
 		 139 aa  206  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3962  putative thioredoxin protein  78.99 
 
 		 148 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2498  putative thioredoxin protein  76.47 
 
 		 143 aa  192  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1307  hypothetical protein  78.95 
 
 		 143 aa  183  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3312  thioredoxin family protein  80.7 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3279  thioredoxin family protein  80.7 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0785061  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1100  hypothetical protein  80.7 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0499  hypothetical protein  80.7 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2207  hypothetical protein  80.7 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3323  hypothetical protein  80.7 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2327  hypothetical protein  80.7 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1005  putative thioredoxin protein  65.25 
 
 		 134 aa  168  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1041  putative thioredoxin protein  65.81 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2638  putative thioredoxin protein  64.17 
 
 		 140 aa  147  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.566673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2467  putative thioredoxin protein  69.17 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2873  putative thioredoxin protein  66.67 
 
 		 141 aa  143  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  26.47 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  26.73 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2624  thioredoxin  27.5 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000156705  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  28.3 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  31.76 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  40.43 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  33.33 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  26.04 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  31.68 
 
 		 160 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1144  thioredoxin  25.96 
 
 		 421 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  29.63 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  28.87 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  23.96 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0832  thioredoxin  28.75 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0859  Thioredoxin domain protein  24.76 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827766  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3281  thioredoxin  28.28 
 
 		 109 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>