30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6635 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6635  putative integrase protein  100 
 
 		 373 aa  766    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000253479  hitchhiker  0.0000000190144 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0013  integrase, catalytic region  57.1 
 
 		 554 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.581466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0166  putative integrase protein  51.51 
 
 		 553 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13890  putative integrase protein  60 
 
 		 336 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.216731  normal  0.122609 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0608  putative integrase protein  51.97 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.346201 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0607  putative integrase protein  62.86 
 
 		 106 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0386  phage integrase family site specific recombinase  65.59 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1105  integrase catalytic subunit  26.91 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0473204  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0312  Integrase catalytic region  26.96 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3191  Integrase catalytic region  27.04 
 
 		 417 aa  56.2  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000157181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2820  Integrase catalytic region  27.04 
 
 		 417 aa  56.2  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1682  Integrase catalytic region  27.04 
 
 		 417 aa  56.2  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12826  transposase  30 
 
 		 469 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44117e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0381  integrase catalytic subunit  25.93 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0544  integrase catalytic subunit  25.93 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.265235  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1107  integrase catalytic subunit  25.93 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.515553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1874  integrase catalytic subunit  25.93 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1894  Integrase catalytic region  24.79 
 
 		 666 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  26.37 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2716  hypothetical protein  23.98 
 
 		 594 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0945a  transposase  26.47 
 
 		 276 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  28.71 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1828  Integrase catalytic region  26.03 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.422138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  28.22 
 
 		 325 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3239  integrase catalytic subunit  26.71 
 
 		 330 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2257  integrase catalytic subunit  26.71 
 
 		 459 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1285  integrase catalytic subunit  26.71 
 
 		 459 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1010  integrase catalytic subunit  26.71 
 
 		 459 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0532  integrase catalytic subunit  26.71 
 
 		 459 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5456  integrase catalytic region  28.07 
 
 		 547 aa  42.7  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0520655  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>