49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5520 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5520  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
259 aa  530  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.890921  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5753  GCN5-related N-acetyltransferase  93.82 
 
 
259 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0369  GCN5-related N-acetyltransferase  38.86 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1239  acetyltransferase  34.33 
 
 
281 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1562  acetyltransferase  34.33 
 
 
281 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0134  acetyltransferase  34.33 
 
 
281 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1643  acetyltransferase  34.33 
 
 
281 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0553  acetyltransferase  34.33 
 
 
273 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0569  acetyltransferase  34.33 
 
 
273 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2915  acetyltransferase  34.33 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1486  acetyltransferase  34.33 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0103  acetyltransferase  34.33 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.864372  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0736  acetyltransferase  34.33 
 
 
411 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3134  acetyltransferase  34.33 
 
 
411 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0460  acetyltransferase  33.58 
 
 
367 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2761  GCN5-related protein N-acetyltransferase  27.71 
 
 
274 aa  55.5  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.30165  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1704  GCN5-related N-acetyltransferase  39.24 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5516  GCN5-related N-acetyltransferase  35.16 
 
 
300 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0715522  normal  0.230819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1854  GCN5-related N-acetyltransferase  36.55 
 
 
287 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.794168  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7312  hypothetical protein  39.08 
 
 
262 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  26.83 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0607  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000261926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0682  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 
269 aa  47  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.341989  normal  0.410017 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3997  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  29.55 
 
 
265 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6669  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
300 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.097443  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6434  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
300 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3551  GCN5-related N-acetyltransferase  40.35 
 
 
129 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2106  hypothetical protein  20.73 
 
 
252 aa  45.8  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4408  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
349 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.469823  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0119  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1863  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 
418 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5987  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
156 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1945  GCN5-related N-acetyltransferase  22.9 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.98444  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6068  GCN5-related N-acetyltransferase  33.67 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6365  GCN5-related N-acetyltransferase  33.67 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3334  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
251 aa  43.9  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.141564 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10841  hypothetical protein  26.47 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3011  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2756  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 
149 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2095  hypothetical protein  21.27 
 
 
257 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1348  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
257 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0414248 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6093  GCN5-related N-acetyltransferase  39.44 
 
 
294 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335222  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8386  GCN5-related N-acetyltransferase  27.46 
 
 
257 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2130  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
163 aa  42.4  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3204  acetyltransferase  27.06 
 
 
261 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 
256 aa  42.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7086  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 
236 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2110  acetyltransferase  22.79 
 
 
261 aa  42  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1848  GCN5-related N-acetyltransferase  24.26 
 
 
265 aa  42  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>