71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2770 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
233 aa  483  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4304  GCN5-related N-acetyltransferase  26.03 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3997  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  30 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3846  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 
246 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4522  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 
246 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136735  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2623  acetyltransferase, GNAT family  35.38 
 
 
266 aa  52  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000303588 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2688  acetyltransferase, GNAT family  35.38 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4781  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112634  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0265  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
160 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.53 
 
 
148 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.967932  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3134  acetyltransferase  34.62 
 
 
411 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0736  acetyltransferase  34.62 
 
 
411 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1602  GCN5-related N-acetyltransferase  22 
 
 
267 aa  49.7  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000575881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0553  acetyltransferase  34.62 
 
 
273 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0569  acetyltransferase  34.62 
 
 
273 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1326  GCN5-related N-acetyltransferase  30.68 
 
 
271 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0607  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
318 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000261926 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2915  acetyltransferase  34.62 
 
 
273 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0103  acetyltransferase  34.62 
 
 
273 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.864372  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10841  hypothetical protein  23.85 
 
 
261 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1486  acetyltransferase  34.62 
 
 
273 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2732  acetyltransferase, GNAT family  21.43 
 
 
266 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1863  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
418 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0460  acetyltransferase  34.62 
 
 
367 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.08 
 
 
151 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5520  GCN5-related N-acetyltransferase  26.83 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.890921  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2095  hypothetical protein  26.37 
 
 
257 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2702  acetyltransferase  30.77 
 
 
266 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000361554  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1239  acetyltransferase  32.05 
 
 
281 aa  46.2  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2681  acetyltransferase, GNAT family  30.77 
 
 
242 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000458836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0369  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
256 aa  45.8  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2134  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
148 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2667  acetyltransferase  29.23 
 
 
266 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2483  acetyltransferase  29.23 
 
 
266 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.022509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2445  acetyltransferase  29.23 
 
 
266 aa  45.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000291129  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2424  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.09 
 
 
148 aa  45.1  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2106  hypothetical protein  27.59 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05053  conserved hypothetical protein  32.18 
 
 
298 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000048747  hitchhiker  0.0000000000000222827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2798  acetyltransferase  32.61 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.097578  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  25.84 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0120846  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5753  GCN5-related N-acetyltransferase  26 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2473  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
94 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.037038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2414  acetyltransferase  21.57 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05633  hypothetical protein  21.25 
 
 
136 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001152  histone acetyltransferase HPA2  44.23 
 
 
151 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000449309  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2460  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.46812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1617  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
188 aa  42.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2661  GCN5-related protein N-acetyltransferase  26.73 
 
 
284 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.320642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1858  hypothetical protein  31.17 
 
 
422 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346316  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0906  acetyltransferase  30.28 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1210  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 
269 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.34789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.47 
 
 
148 aa  42.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.47 
 
 
148 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.47 
 
 
148 aa  42.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  32.47 
 
 
148 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.47 
 
 
148 aa  42.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3246  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
147 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000002184  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5211  putative acetyltransferase  29.58 
 
 
255 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.47 
 
 
148 aa  42.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.47 
 
 
148 aa  42.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  32.47 
 
 
148 aa  42.7  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
138 aa  42.4  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  24.49 
 
 
160 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862709  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2184  GCN5-related N-acetyltransferase  26.61 
 
 
148 aa  42  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.553749  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3551  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
129 aa  42  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0883  hypothetical protein  34.38 
 
 
241 aa  42  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4393  acetyltransferase  27.78 
 
 
151 aa  42  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0616  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 
183 aa  42  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.120941  normal  0.314865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1981  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
239 aa  42  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.63 
 
 
156 aa  41.6  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0940  GCN5-related N-acetyltransferase  27.36 
 
 
161 aa  41.6  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>