45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1854 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1854  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
287 aa  567  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.794168  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4787  acetyltransferase-like protein  43.17 
 
 
295 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.031832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7336  acetyltransferase-like protein  44 
 
 
273 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2541  GCN5-related N-acetyltransferase  41.2 
 
 
273 aa  162  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2882  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
281 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0899618  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2895  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
281 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.446946  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2851  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
281 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0620  GCN5-related N-acetyltransferase  31.56 
 
 
287 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.0919465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1374  GCN5-related N-acetyltransferase  36.82 
 
 
291 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3472  GCN5-related N-acetyltransferase  36.61 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.218378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4148  GCN5-related N-acetyltransferase  33.81 
 
 
284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1945  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.423953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3562  acetyltransferase  25.64 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1661  acetyltransferase, GNAT family  25.28 
 
 
277 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000160282 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3251  GCN5-related N-acetyltransferase  25.26 
 
 
277 aa  92.4  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0334515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3566  acetyltransferase, GNAT family  35 
 
 
277 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.609379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3603  acetyltransferase  35.88 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.227909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3342  acetyltransferase  35.88 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3307  acetyltransferase  35.88 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3556  acetyltransferase, GNAT family  34.27 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000567392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3656  acetyltransferase, GNAT family  25.28 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3257  acetyltransferase  43.82 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2132  hypothetical protein  85.71 
 
 
43 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0049  hypothetical protein  29.93 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0047  hypothetical protein  30.61 
 
 
292 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
287 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3078  GCN5-related N-acetyltransferase  29.23 
 
 
289 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5520  GCN5-related N-acetyltransferase  36.55 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.890921  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5753  GCN5-related N-acetyltransferase  36.55 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0268  GCN5-related protein N-acetyltransferase  34.09 
 
 
312 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  hitchhiker  0.00359764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4039  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 
169 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.880939  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2433  GCN5-related N-acetyltransferase  39.19 
 
 
228 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000357302  normal  0.518227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0369  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7759  GCN5-related N-acetyltransferase  33.88 
 
 
286 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1225  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
180 aa  46.6  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0331323 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0214  hypothetical protein  27.05 
 
 
171 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2760  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
134 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2805  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
134 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.121712  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1586  acetyltransferase  27.85 
 
 
130 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.569606  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0469  GCN5-related N-acetyltransferase  22.42 
 
 
272 aa  43.5  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000185465  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1542  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  36.36 
 
 
145 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1723  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  36.36 
 
 
145 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.173475 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0208  hypothetical protein  26.23 
 
 
171 aa  42.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1736  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  36.36 
 
 
145 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.771756  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1733  aminoglycoside 6'-N-acetyltransferase Iz  36.36 
 
 
145 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.247434  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>