12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1915 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1915  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  202  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.644211  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2075  hypothetical protein  86.32 
 
 
135 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1928  hypothetical protein  89.29 
 
 
80 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0328337  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2428  hypothetical protein  82.93 
 
 
260 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9202  hypothetical protein  40.19 
 
 
231 aa  67  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2768  hypothetical protein  47.56 
 
 
246 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6752  hypothetical protein  45.12 
 
 
218 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.607582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0662  hypothetical protein  40.4 
 
 
175 aa  47  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.123664  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4733  hypothetical protein  39.02 
 
 
215 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5297  hypothetical protein  42.19 
 
 
232 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.698895  normal  0.187901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2342  hypothetical protein  34.58 
 
 
212 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05661  hypothetical protein  28.26 
 
 
195 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>