74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2042 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2042  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  487  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0752  hypothetical protein  99.18 
 
 		 243 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0661  hypothetical protein  98.68 
 
 		 152 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850631  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1928  transmembrane protein  88.62 
 
 		 123 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.696294  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4503  membrane protein-like protein  69.11 
 
 		 123 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.151573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3491  membrane protein-like protein  69.11 
 
 		 123 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1964  membrane protein-like  68.29 
 
 		 123 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3977  membrane protein-like protein  69.11 
 
 		 123 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.109107  normal  0.438253 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3444  membrane protein-like protein  66.67 
 
 		 123 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.579203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4079  membrane protein-like protein  66.67 
 
 		 123 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4287  membrane protein-like  66.67 
 
 		 123 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1679  membrane protein-like protein  60.66 
 
 		 124 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.384201 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0788  hypothetical protein  47.11 
 
 		 127 aa  99.4  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.784909 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2432  hypothetical protein  44.35 
 
 		 128 aa  99  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.687414  normal  0.0885444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5274  hypothetical protein  43.65 
 
 		 127 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0734  putative transmembrane protein  47.93 
 
 		 127 aa  95.5  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106149  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0816  hypothetical protein  47.93 
 
 		 127 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0838282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0493  hypothetical protein  44.53 
 
 		 128 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1132  hypothetical protein  39.84 
 
 		 126 aa  92.8  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.202391  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0804  hypothetical protein  46.28 
 
 		 127 aa  91.7  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1621  hypothetical protein  43.2 
 
 		 133 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.183989  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4845  hypothetical protein  44.53 
 
 		 128 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.126737  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0450  membrane protein-like protein  40.94 
 
 		 128 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5021  hypothetical protein  44.53 
 
 		 128 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850985 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0849  hypothetical protein  39.84 
 
 		 127 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4972  hypothetical protein  43.75 
 
 		 128 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3708  hypothetical protein  39.06 
 
 		 127 aa  87  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0294  membrane protein-like protein  44.63 
 
 		 123 aa  87  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3173  hypothetical protein  39.06 
 
 		 127 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3269  hypothetical protein  39.06 
 
 		 127 aa  86.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0321  membrane protein-like protein  44.63 
 
 		 123 aa  85.5  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0441228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2496  membrane protein-like protein  44.44 
 
 		 130 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.040419  normal  0.199912 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2164  hypothetical protein  37.5 
 
 		 128 aa  85.1  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0906  hypothetical protein  39.84 
 
 		 127 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1222  hypothetical protein  47.13 
 
 		 128 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2191  hypothetical protein  36 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3004  hypothetical protein  38.28 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182987  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0831  transmembrane protein  42.98 
 
 		 128 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07020  hypothetical protein  38.58 
 
 		 128 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3353  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1010  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1022  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.833543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0988  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4798  hypothetical protein  41.13 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2647  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00167697 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2333  membrane protein-like protein  36.29 
 
 		 130 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.632219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0643  hypothetical protein  38.4 
 
 		 128 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0380  hypothetical protein  39.52 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2271  membrane protein-like  31.69 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1510  membrane protein-like protein  45.61 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2347  membrane protein-like protein  45.61 
 
 		 135 aa  74.7  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1356  hypothetical protein  31.75 
 
 		 135 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0636538 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4078  hypothetical protein  36.29 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000581683  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2866  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0720  hypothetical protein  40.87 
 
 		 128 aa  72  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3728  hypothetical protein  38.84 
 
 		 127 aa  72  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.04039  normal  0.0800584 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0936  hypothetical protein  40.22 
 
 		 127 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000828174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2000  hypothetical protein  38.78 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4900  membrane protein-like protein  50.62 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3371  hypothetical protein  35.9 
 
 		 127 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.994357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3416  hypothetical protein  35.59 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2325  membrane protein-like protein  37.29 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540964 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0927  hypothetical protein  34.13 
 
 		 132 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2531  hypothetical protein  42.86 
 
 		 133 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247104  normal  0.592717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2744  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.200077 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02203  hypothetical protein  35.11 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1852  hypothetical protein  32.43 
 
 		 135 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1826  hypothetical protein  32.43 
 
 		 135 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2308  hypothetical protein  32.2 
 
 		 141 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0756  hypothetical protein  39.42 
 
 		 129 aa  48.5  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3506  inner membrane protein  35.9 
 
 		 136 aa  45.8  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.701287  normal  0.583809 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2005  hypothetical protein  33.04 
 
 		 141 aa  45.4  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0963  inner membrane protein  36.99 
 
 		 131 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2623  inner membrane protein  36.99 
 
 		 131 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>