35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3312 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3312  thioredoxin family protein  100 
 
 
143 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2207  hypothetical protein  99.3 
 
 
143 aa  278  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1100  hypothetical protein  99.3 
 
 
143 aa  278  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0499  hypothetical protein  99.3 
 
 
143 aa  278  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3279  thioredoxin family protein  99.3 
 
 
143 aa  278  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0785061  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3323  hypothetical protein  99.3 
 
 
143 aa  278  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2327  hypothetical protein  99.3 
 
 
143 aa  278  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1307  hypothetical protein  83.22 
 
 
143 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3962  putative thioredoxin protein  76.8 
 
 
148 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0668  hypothetical protein  80.51 
 
 
146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134964  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3838  hypothetical protein  73.13 
 
 
141 aa  194  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0645  hypothetical protein  79.66 
 
 
146 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2498  putative thioredoxin protein  75.2 
 
 
143 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120918  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0720  hypothetical protein  80.91 
 
 
152 aa  181  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535898  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0267  hypothetical protein  80 
 
 
147 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0751  hypothetical protein  80 
 
 
147 aa  179  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329812  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2634  hypothetical protein  79.09 
 
 
139 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1005  putative thioredoxin protein  63.03 
 
 
134 aa  163  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1041  putative thioredoxin protein  63.03 
 
 
141 aa  161  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2873  putative thioredoxin protein  67.21 
 
 
141 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2467  putative thioredoxin protein  68.64 
 
 
141 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2638  putative thioredoxin protein  60.83 
 
 
140 aa  138  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.566673  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1717  thioredoxin  25.27 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1823  thioredoxin  27.96 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2654  thioredoxin-related protein  37.14 
 
 
370 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.540425 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1776  thioredoxin  23.6 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000224157  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  24.73 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0241  Thioredoxin domain protein  28.26 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.83806e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2360  thioredoxin domain-containing protein  30.93 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.177499  hitchhiker  0.00135525 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1808  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  23.6 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00521998  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  31.94 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0025  thioredoxin  33.33 
 
 
238 aa  40.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0364  thioredoxin  25.61 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0859  Thioredoxin domain protein  25.93 
 
 
107 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827766  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  30.26 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>