40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1509 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1479  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  322  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.241706  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1509  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  322  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1612  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  322  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0774  hypothetical protein  99.4 
 
 
167 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.46119  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0583  hypothetical protein  99.4 
 
 
167 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.372636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1285  hypothetical protein  99.4 
 
 
167 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.137932  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0568  hypothetical protein  99.4 
 
 
167 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.399783  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2779  hypothetical protein  92.22 
 
 
167 aa  299  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.333542  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1259  hypothetical protein  75.82 
 
 
169 aa  239  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2865  hypothetical protein  75.16 
 
 
169 aa  239  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0570173  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0876  hypothetical protein  74.05 
 
 
166 aa  231  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.810524  normal  0.0626791 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1183  hypothetical protein  72.85 
 
 
152 aa  227  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1171  hypothetical protein  71.9 
 
 
155 aa  227  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4436  hypothetical protein  72.19 
 
 
152 aa  226  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1265  hypothetical protein  72.19 
 
 
152 aa  225  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.238784 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0813  hypothetical protein  72.19 
 
 
152 aa  225  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1294  hypothetical protein  72.19 
 
 
152 aa  225  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2026  hypothetical protein  71.14 
 
 
152 aa  221  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1523  hypothetical protein  61.74 
 
 
155 aa  168  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.934118  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1724  hypothetical protein  60.4 
 
 
155 aa  160  7e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2191  hypothetical protein  53.42 
 
 
163 aa  153  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00524739  normal  0.0689108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2032  putative transmembrane protein  60.96 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2173  transmembrane protein  53.79 
 
 
167 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1016  hypothetical protein  43.24 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0781  hypothetical protein  42.86 
 
 
151 aa  95.9  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000248599  hitchhiker  0.0000184506 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1264  hypothetical protein  40.88 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0257233 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0941  hypothetical protein  40.14 
 
 
153 aa  77  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1130  hypothetical protein  40 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2008  hypothetical protein  33.78 
 
 
136 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299428  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1649  hypothetical protein  27.08 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2613  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  52.4  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1979  hypothetical protein  36.3 
 
 
150 aa  51.2  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4929  hypothetical protein  30.32 
 
 
147 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.309101 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2620  hypothetical protein  32.47 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224244  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1145  hypothetical protein  42.86 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1796  hypothetical protein  29.37 
 
 
146 aa  48.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00356379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3306  hypothetical protein  26.77 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316437  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2388  hypothetical protein  32.89 
 
 
137 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.558847  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1470  hypothetical protein  32.24 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0851  conserved hypothetical membrane spanning protein  41.38 
 
 
63 aa  42.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.276761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>