16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0775 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0775  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.779047  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1604  putative PilM  86.79 
 
 
159 aa  240  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000242802  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0650  hypothetical protein  86.79 
 
 
159 aa  240  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1985  putative PilM  86.79 
 
 
159 aa  240  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2251  putative type IV pilus protein  86.79 
 
 
159 aa  240  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2167  putative type IV pilus protein  86.79 
 
 
159 aa  240  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00337132  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0664  putative PilM  86.79 
 
 
159 aa  240  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5874  pilM; PilM  41.28 
 
 
159 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5657  PilM; PilM  45.93 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696203 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1509  PilM protein, putative  33.08 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5916  hypothetical protein  34.97 
 
 
158 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949075  hitchhiker  0.00869431 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5247  hypothetical protein  27.74 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180104  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5444  PilM protein, putative  26.17 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0338248  normal  0.111722 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0012  type IV pilus biogenesis protein PilM  26.19 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0007  PilM protein, putative  29.73 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390397  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59360  type IV B pilus protein  33.7 
 
 
145 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00299315  hitchhiker  0.00000000000125357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>