38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2134 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2134  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1408  hypothetical protein  99.65 
 
 
282 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.857501  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3180  hypothetical protein  99.65 
 
 
282 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2519  hypothetical protein  98.94 
 
 
282 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2660  hypothetical protein  98.58 
 
 
282 aa  554  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2572  hypothetical protein  98.58 
 
 
282 aa  554  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.544506  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1959  hypothetical protein  95.74 
 
 
282 aa  525  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0936  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366829  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  42.11 
 
 
389 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  30.22 
 
 
257 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.04 
 
 
232 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1428  methyltransferase type 12  27.07 
 
 
285 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678135  hitchhiker  0.000594475 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
262 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  33.66 
 
 
217 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  40.58 
 
 
409 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.52 
 
 
238 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2187  putative methyltransferase  30 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000631484  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.3 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  26.21 
 
 
241 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  26.96 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  28.89 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  32.05 
 
 
260 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  36.05 
 
 
439 aa  43.9  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
240 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.44 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.46 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 
240 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  24.83 
 
 
239 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.24 
 
 
237 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.24 
 
 
237 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  34.17 
 
 
398 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.82 
 
 
711 aa  42.7  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4018  hypothetical protein  28.4 
 
 
184 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  35.29 
 
 
328 aa  42.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  30.38 
 
 
415 aa  42.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0687  hypothetical protein  21.69 
 
 
243 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0713  methionine biosynthesis protein MetW  33 
 
 
197 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.749349  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>