23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0936 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0936  methyltransferase type 11  100 
 
 
274 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366829  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1959  hypothetical protein  31.75 
 
 
282 aa  85.5  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2660  hypothetical protein  35.92 
 
 
282 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2572  hypothetical protein  35.92 
 
 
282 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.544506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1408  hypothetical protein  31.02 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.857501  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3180  hypothetical protein  31.02 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2134  hypothetical protein  31.02 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2519  hypothetical protein  35.92 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.9704  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  31.4 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1428  methyltransferase type 12  29.17 
 
 
285 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678135  hitchhiker  0.000594475 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2453  methyltransferase type 12  28.14 
 
 
542 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  34.62 
 
 
393 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  37.97 
 
 
393 aa  46.6  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3998  hypothetical protein  25.67 
 
 
251 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4745  hypothetical protein  27.8 
 
 
322 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211632  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0752  putative methylase  27.78 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.016258  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54270  hypothetical protein  28.92 
 
 
322 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  30.64 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2697  methyltransferase type 12  28.81 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 
262 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  34.29 
 
 
400 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1481  putative methyltransferase  25.98 
 
 
322 aa  42.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>