71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1751 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_2204    100 
 
 
801 bp  1588    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1867  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92 
 
 
1263 bp  977    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1195  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  89.38 
 
 
1263 bp  827    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  92 
 
 
1263 bp  977    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6212  transposase IS116/IS110/IS902  92 
 
 
1263 bp  977    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4744  transposase IS116/IS110/IS902  92 
 
 
1263 bp  977    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4714  transposase IS116/IS110/IS902  92 
 
 
1263 bp  977    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3689  transposase IS116/IS110/IS902  92 
 
 
1263 bp  977    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.767433  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2654  transposase IS116/IS110/IS902  92 
 
 
1263 bp  977    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2516  transposase IS116/IS110/IS902  92 
 
 
1263 bp  977    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0716  transposase IS116/IS110/IS902  89.38 
 
 
1263 bp  827    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31796  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0354  transposase IS116/IS110/IS902  92 
 
 
1263 bp  977    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1751    100 
 
 
801 bp  1588    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0183737  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1755  ISBma3, transposase  89.66 
 
 
1263 bp  842    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1190  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  90.55 
 
 
1206 bp  900    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140816  normal  0.0159286 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0890    100 
 
 
801 bp  1588    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120752  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0480    97.24 
 
 
1224 bp  1421    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1893  transposase  97.87 
 
 
1281 bp  1461    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  90.55 
 
 
1206 bp  900    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1545  ISBma3, transposase  89.66 
 
 
1263 bp  842    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1754  ISBma3, transposase  89.66 
 
 
1263 bp  842    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534372  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3194  ISBma3, transposase  89.66 
 
 
1263 bp  842    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0847  ISBma3, transposase, truncation  100 
 
 
801 bp  1588    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2836  ISBma3, transposase  89.66 
 
 
1263 bp  842    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0576    96.74 
 
 
1293 bp  1390    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0983085  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2763  putative transposase IS110  83.73 
 
 
1263 bp  494  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0156  putative transposase  83.73 
 
 
1263 bp  494  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3480  putative transposase  83.73 
 
 
1263 bp  494  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2705  putative IS110 transposase  86.19 
 
 
771 bp  476  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1387  transposase  82.3 
 
 
1263 bp  418  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1289  transposase  82.3 
 
 
1263 bp  418  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2615  transposase  82.3 
 
 
1263 bp  418  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0243344  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0735  transposase  82.3 
 
 
1263 bp  418  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0642  transposase  82.3 
 
 
1263 bp  418  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1964  transposase  82.3 
 
 
1263 bp  418  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7787    81.99 
 
 
1261 bp  281  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511104  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0103  putative transposase  81.4 
 
 
738 bp  153  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0273  transposase  79.6 
 
 
1197 bp  129  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0230  transposase  79.6 
 
 
1197 bp  129  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0312  transposase  79.6 
 
 
1197 bp  129  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1103    79.6 
 
 
2017 bp  129  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1104  transposase  79.6 
 
 
1197 bp  129  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2541  transposase  79.6 
 
 
1197 bp  129  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0777967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2865  transposase  79.6 
 
 
1197 bp  129  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3346  transposase  79.6 
 
 
1197 bp  129  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3846  transposase  79.6 
 
 
1197 bp  129  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4033  transposase  79.6 
 
 
1197 bp  129  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4876  transposase  79.6 
 
 
1197 bp  129  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0142  transposase  79.6 
 
 
1197 bp  129  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.784062  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2725  transposase  79.32 
 
 
1197 bp  121  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1992  transposase  79.32 
 
 
1197 bp  121  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.546603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1953  transposase  79.32 
 
 
1197 bp  121  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12160  transposase  80.2 
 
 
1227 bp  81.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145073  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21750  transposase  80.2 
 
 
1227 bp  81.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.747437  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4393  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  92 
 
 
1266 bp  67.9  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4694  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  83.95 
 
 
1212 bp  58  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2708    83.15 
 
 
579 bp  58  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  96.88 
 
 
1863 bp  56  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2472  putative phytochelatin synthase  94.29 
 
 
1053 bp  54  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2416  putative phytochelatin synthase  94.29 
 
 
1065 bp  54  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0257304  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5296  hypothetical protein  96.67 
 
 
255 bp  52  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882847  normal  0.168446 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5713  hypothetical protein  96.67 
 
 
255 bp  52  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7170  LuxR family transcriptional regulator  96.55 
 
 
723 bp  50.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30950  predicted protein  96.55 
 
 
699 bp  50.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000115683  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_12474  predicted protein  96.55 
 
 
3467 bp  50.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161702  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2691  hypothetical protein  96.55 
 
 
1221 bp  50.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.559583  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2799  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  96.55 
 
 
885 bp  50.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0976082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3341  EmrB/QacA family drug resistance transporter  96.43 
 
 
1554 bp  48.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32216  DMT family transporter: drug/metabolite  96.43 
 
 
1815 bp  48.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681934  normal  0.0531718 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29095  P-ATPase family transporter: calcium ion  100 
 
 
3220 bp  48.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  96.43 
 
 
2223 bp  48.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>