81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0783 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0783    100 
 
 
336 bp  666    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1076    100 
 
 
336 bp  666    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1790  hypothetical protein  100 
 
 
336 bp  666    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.35129  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2050    100 
 
 
336 bp  666    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.35138  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0034  bacteriophage/transposase fusion protein  100 
 
 
321 bp  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00236951  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0534  bacteriophage/transposase fusion protein  100 
 
 
1200 bp  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1942  bacteriophage/transposase fusion protein  100 
 
 
504 bp  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3040  bacteriophage/transposase fusion protein  100 
 
 
429 bp  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1945  bacteriophage/transposase fusion protein  100 
 
 
1389 bp  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0546  bacteriophage/transposase fusion protein  100 
 
 
480 bp  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5887  bacteriophage/transposase fusion protein  92.62 
 
 
132 bp  170  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.146263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1579  transposase IS3/IS911 family protein  91.94 
 
 
1136 bp  83.8  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17333  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2798  transposase IS3/IS911 family protein  91.94 
 
 
1136 bp  83.8  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0913073  normal  0.317716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2802  transposase IS3/IS911 family protein  91.94 
 
 
1136 bp  83.8  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3074  transposase IS3/IS911 family protein  91.94 
 
 
1136 bp  83.8  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404952  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  89.09 
 
 
882 bp  61.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  89.09 
 
 
882 bp  61.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  89.09 
 
 
882 bp  61.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  89.09 
 
 
882 bp  61.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  89.09 
 
 
882 bp  61.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0151  transposase  100 
 
 
213 bp  56  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.405361  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0302  amino acid adenylation  100 
 
 
156 bp  54  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0109  hypothetical protein  100 
 
 
516 bp  54  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00195405  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2024  hypothetical protein  100 
 
 
516 bp  54  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1293    100 
 
 
156 bp  54  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.789728  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2261  hypothetical protein  100 
 
 
516 bp  54  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02981  putative transposase  92.31 
 
 
813 bp  54  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1393  Integrase catalytic region  92.31 
 
 
816 bp  54  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2887  Integrase catalytic region  92.31 
 
 
816 bp  54  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3070  hypothetical protein  100 
 
 
516 bp  54  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1053  hypothetical protein  100 
 
 
1158 bp  54  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.74132  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1076    100 
 
 
294 bp  54  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1297  hypothetical protein  100 
 
 
189 bp  54  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0173    100 
 
 
90 bp  54  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1784    100 
 
 
189 bp  54  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.674387  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1599  YadA-like C-terminal region protein  100 
 
 
1380 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0440    100 
 
 
108 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1009  hypothetical protein  100 
 
 
1551 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2294  ISBma2, transposase  100 
 
 
1530 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.104034  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3328  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
1254 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0779  integrase catalytic region  88 
 
 
888 bp  52  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000297948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1961  integrase catalytic region  88 
 
 
888 bp  52  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2281  integrase catalytic region  88 
 
 
888 bp  52  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2382  integrase catalytic region  88 
 
 
888 bp  52  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3166  integrase catalytic region  88 
 
 
888 bp  52  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0141846 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4143  integrase catalytic region  88 
 
 
888 bp  52  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0810  YadA-like C-terminal region protein  100 
 
 
1380 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0496  hypothetical protein  100 
 
 
297 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0435  serine protease  100 
 
 
459 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3350  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
1254 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1233  ISBma1, transposase, interruption-C  100 
 
 
498 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1084  hypothetical protein  100 
 
 
324 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0587    100 
 
 
228 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0482    100 
 
 
246 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1176  hypothetical protein  100 
 
 
651 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3019  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
1254 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0646  YadA-like C-terminal region protein  100 
 
 
1380 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0378174  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2899  ISBma1, transposase  100 
 
 
192 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.629889  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1816    100 
 
 
459 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207895  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  100 
 
 
10059 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0157  putative lipoprotein  100 
 
 
1560 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.764753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1994  ISBma2, transposase  100 
 
 
1530 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.552518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2073  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
1254 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2230  hypothetical protein  100 
 
 
933 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3406  transposase OrfA  100 
 
 
180 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2132  hypothetical protein  100 
 
 
117 bp  52  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249244  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1485    100 
 
 
1221 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.471497  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0685    100 
 
 
297 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  92.11 
 
 
870 bp  52  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1413    100 
 
 
467 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0487    100 
 
 
459 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0621    100 
 
 
10059 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1499  MOSC domain-containing protein  100 
 
 
780 bp  52  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0889  hypothetical protein  96.55 
 
 
285 bp  50.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0925  hypothetical protein  96.55 
 
 
285 bp  50.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31679  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0025  hypothetical protein  96.55 
 
 
285 bp  50.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3082  integrase catalytic region  91.43 
 
 
834 bp  46.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal  0.758982 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2947    91.43 
 
 
1052 bp  46.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1640  hypothetical protein  96.3 
 
 
150 bp  46.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.535899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2961  hypothetical protein  96.3 
 
 
150 bp  46.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3408  hypothetical protein  96.3 
 
 
150 bp  46.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.53884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>