50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0710 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0710  putative permease  100 
 
 
290 aa  594  1e-169  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.299294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 
410 aa  58.5  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  24.69 
 
 
381 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
391 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
404 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  25.31 
 
 
399 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  25.31 
 
 
381 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  27.22 
 
 
447 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  24.69 
 
 
384 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  25.35 
 
 
400 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  24.69 
 
 
381 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  24.07 
 
 
381 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  25.68 
 
 
400 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  24.07 
 
 
381 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  24.07 
 
 
381 aa  52.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  24.07 
 
 
381 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  29.07 
 
 
390 aa  52.8  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 
419 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  25.99 
 
 
399 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  25.99 
 
 
399 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  23.46 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  26.67 
 
 
400 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  26.67 
 
 
400 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  26.14 
 
 
399 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  25.23 
 
 
506 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  25.99 
 
 
399 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  25.79 
 
 
399 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  25.6 
 
 
399 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  26.14 
 
 
399 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  26.14 
 
 
399 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  24.42 
 
 
400 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  26.14 
 
 
399 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 
408 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  25.79 
 
 
399 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  24.42 
 
 
506 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2538  major facilitator transporter  22.9 
 
 
397 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2489  major facilitator transporter  22.9 
 
 
397 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2367  transporter, putative  23.88 
 
 
396 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  34.33 
 
 
401 aa  45.8  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  24.69 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  23.97 
 
 
412 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0531  major facilitator superfamily transporter  27.82 
 
 
388 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 
396 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  24.42 
 
 
399 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  24.42 
 
 
505 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  26.88 
 
 
400 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1511  major facilitator transporter  25 
 
 
399 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  23.6 
 
 
392 aa  42.4  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
401 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>