155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0367 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0367  CvpA family protein  100 
 
 
161 aa  317  3.9999999999999996e-86  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.202665  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  56.69 
 
 
166 aa  186  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1534  colicin V production protein  57.96 
 
 
169 aa  185  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.452834  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1470  colicin V production protein  56.69 
 
 
166 aa  185  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0356  colicin V production protein  57.96 
 
 
169 aa  185  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1425  colicin V production protein  57.96 
 
 
169 aa  185  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  56.05 
 
 
166 aa  184  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2571  colicin V production protein  55.41 
 
 
163 aa  183  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1373  colicin V production protein  54.78 
 
 
163 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02238  membrane protein required for colicin V production  52.23 
 
 
162 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1339  colicin V production protein  52.23 
 
 
162 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2469  colicin V production protein  52.23 
 
 
162 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02198  hypothetical protein  52.23 
 
 
162 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  52.87 
 
 
162 aa  177  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2464  colicin V production protein  52.23 
 
 
162 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2607  colicin V production protein  52.23 
 
 
162 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3453  colicin V production protein  52.23 
 
 
162 aa  176  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2505  colicin V production protein  52.87 
 
 
162 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2714  colicin V production protein  52.87 
 
 
162 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134664  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2593  colicin V production protein  52.87 
 
 
162 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272788  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2605  colicin V production protein  52.87 
 
 
162 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2551  colicin V production protein  52.87 
 
 
162 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1343  Colicin V production protein  51.59 
 
 
162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0732005  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2691  colicin V production protein  51.59 
 
 
162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  46.5 
 
 
162 aa  159  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  45.86 
 
 
162 aa  159  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  47.13 
 
 
162 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  46.5 
 
 
162 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  45.86 
 
 
163 aa  157  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  45.86 
 
 
162 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  45.86 
 
 
162 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  45.86 
 
 
162 aa  154  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  45.86 
 
 
162 aa  155  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  45.22 
 
 
162 aa  155  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  45.86 
 
 
162 aa  154  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  45.22 
 
 
162 aa  154  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  45.22 
 
 
162 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  44.59 
 
 
162 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  44.59 
 
 
162 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  44.59 
 
 
162 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  44.59 
 
 
162 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  46.5 
 
 
166 aa  151  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  44.94 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  43.31 
 
 
163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  42.68 
 
 
163 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  42.68 
 
 
160 aa  145  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  40.13 
 
 
163 aa  137  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  46.76 
 
 
166 aa  135  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1258  Colicin V production protein  41.33 
 
 
162 aa  111  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  35.14 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  38.62 
 
 
189 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1154  Colicin V production protein  39.87 
 
 
162 aa  100  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  34.42 
 
 
192 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2047  colicin V production protein  35.62 
 
 
177 aa  96.7  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.220439  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  37.16 
 
 
185 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  37.16 
 
 
185 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  37.16 
 
 
185 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  37.16 
 
 
185 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  33.77 
 
 
177 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  33.11 
 
 
177 aa  90.9  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2712  colicin V production protein  35.81 
 
 
170 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  normal  0.143429 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  33.12 
 
 
195 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3812  cvpA family protein  33.12 
 
 
195 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23900  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00157781  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2024  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  32.45 
 
 
171 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1091  colicin V production protein  32.85 
 
 
161 aa  84.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.527466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34160  Colicin V production protein  32.43 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  33.77 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4770  colicin V production protein  30.99 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.161022 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  32.12 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1799  colicin V production protein  31.69 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503822  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  32.12 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1672  colicin V production protein  34.42 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  27.33 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  29.93 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  32.89 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1901  colicin V production protein  33.78 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  28.37 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0960  colicin V production protein  34.09 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0660005  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1051  colicin V production protein  34.09 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  28.67 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6836  Colicin V production protein  30.66 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.612916 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1241  colicin V production protein  30.87 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.599135  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3760  Colicin V production protein  26.62 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2152  colicin V production protein  28.68 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.925685  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2131  Colicin V production protein  32.12 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519275  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  23.75 
 
 
234 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2065  CvpA family protein  27.7 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1723  Colicin V production protein  27.7 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.558498  normal  0.0591031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2283  colicin V production protein  30 
 
 
213 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11201  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1606  colicin V production protein  30.1 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  28.67 
 
 
248 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0777  colicin V production protein  29.37 
 
 
188 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3788  putative colicin V production protein, cvpA-like (dedE protein) (Pur regulon 18 kDa protein)  25.93 
 
 
208 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0129  membrane protein CvpA, putative  33.86 
 
 
196 aa  58.9  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.058893  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0264  colicin V production protein  35.4 
 
 
216 aa  58.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2016  colicin V production protein  26.54 
 
 
210 aa  57.8  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2292  colicin V production protein  26.54 
 
 
238 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  26.32 
 
 
187 aa  57  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>