23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7729 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7729  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0250143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  58.33 
 
 		 205 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  63.93 
 
 		 185 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  59.02 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3529  hypothetical protein  63.33 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452767  normal  0.831541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1206  hypothetical protein  63.33 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  63.46 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  54.1 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  50 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3815  hypothetical protein  46.77 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  45.9 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  54.55 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3017  hypothetical protein  45.16 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  56.36 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1487  hypothetical protein  51.72 
 
 		 211 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  50 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3067  hypothetical protein  60 
 
 		 58 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  46.43 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  47.37 
 
 		 248 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3182  hypothetical protein  40 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860952  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1514  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  37.5 
 
 		 185 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  42.37 
 
 		 261 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>