71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6786 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6786  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  370  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0558411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0702  hypothetical protein  44.97 
 
 
158 aa  134  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.900937  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05658  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  104  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04779  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  104  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5112  transcriptional regulator, ArsR family  43.26 
 
 
263 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1019  transcriptional regulator, ArsR family  39.86 
 
 
250 aa  101  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.736024 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3982  hypothetical protein  37.89 
 
 
153 aa  95.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2390  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.96 
 
 
154 aa  93.2  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.733188  normal  0.497726 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1474  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.62 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3297  transcriptional regulator, ArsR family  35.44 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.481478  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1683  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.14 
 
 
152 aa  79  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327006  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1799  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.19 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3794  hypothetical protein  34.9 
 
 
154 aa  72  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0746  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.47 
 
 
151 aa  70.9  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0777  transcriptional regulator, ArsR family  37.25 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0358  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.69 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1920  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.21 
 
 
260 aa  67.8  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0328503  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3089  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.84 
 
 
161 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.143848  normal  0.342191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2031  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.21 
 
 
268 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.298531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1056  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.86 
 
 
141 aa  59.3  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.566269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1609  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.69 
 
 
178 aa  56.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4686  regulatory protein, ArsR  31.58 
 
 
263 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0399394  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2622  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.95 
 
 
155 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1042  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.77 
 
 
145 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1101  ArsR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
247 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000298233  normal  0.0138971 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1144  hypothetical protein  27.46 
 
 
197 aa  50.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000746366  normal  0.050753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2766  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.72 
 
 
144 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4031  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.47 
 
 
213 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.282258  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2692  ArsR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
250 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0598068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2736  ArsR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
250 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.341929  normal  0.257848 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2722  ArsR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
250 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180734  normal  0.430326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4620  hypothetical protein  48.65 
 
 
154 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4503  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.36 
 
 
143 aa  48.5  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.345264 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1525  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.82 
 
 
142 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3634  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.2 
 
 
317 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1084  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.28 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.523644 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1783  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.93 
 
 
144 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0979418  normal  0.0116667 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2068  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.97 
 
 
136 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4711  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.2 
 
 
317 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89185  normal  0.0124058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25210  polyketide cyclase / dehydrase family protein  23.85 
 
 
322 aa  45.8  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10614  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0968  hypothetical protein  28.36 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4050  activator of Hsp90 ATPase-like protein  30.13 
 
 
182 aa  45.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0940  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.89 
 
 
150 aa  45.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3472  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.88 
 
 
215 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.200808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1819  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.57 
 
 
142 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.154967 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2160  hypothetical protein  28 
 
 
143 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22380  hypothetical protein  29.27 
 
 
162 aa  44.7  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.14979  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2538  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.87 
 
 
240 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1866  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6293  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.87 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4132  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.2 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3920  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.17 
 
 
136 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.170348  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2301  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  26.56 
 
 
136 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0626  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.74 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2023  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.74 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107326  normal  0.0161346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0630  activator of Hsp90 ATPase-like protein  25.4 
 
 
136 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0781  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.97 
 
 
156 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.495784  normal  0.833311 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4657  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.35 
 
 
145 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1126  activator of Hsp90 ATPase-like protein  28 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2052  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.17 
 
 
145 aa  42  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.394992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3783  hypothetical protein  26.57 
 
 
153 aa  42  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1109  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.03 
 
 
152 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.692318 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2105  hypothetical protein  27.27 
 
 
168 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.430302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0681  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.86 
 
 
177 aa  41.6  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4724  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.51 
 
 
135 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862709  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2626  hypothetical protein  28.97 
 
 
159 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000655313  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3602  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.2 
 
 
143 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3926  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.2 
 
 
143 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51721  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4441  activator of Hsp90 ATPase-like  27.2 
 
 
143 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.788827  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0250  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.82 
 
 
153 aa  40.8  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.401314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>