19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4620 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4620  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  316  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4061  hypothetical protein  47.33 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5248  hypothetical protein  44 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  0.102471 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3929  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  40.94 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2800  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.55 
 
 		 269 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000207349  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5507  hypothetical protein  38.31 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0500016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3524  hypothetical protein  37.93 
 
 		 157 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3597  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.93 
 
 		 157 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3529  hypothetical protein  37.24 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12072  hypothetical protein  36.05 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0166  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.57 
 
 		 168 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0175  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.57 
 
 		 172 aa  87.8  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2045  hypothetical protein  34.72 
 
 		 203 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.388066  hitchhiker  0.00198643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5808  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  36.97 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.640792  normal  0.646954 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2508  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.17 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6786  hypothetical protein  48.65 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0558411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1647  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  32.74 
 
 		 167 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0643271 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0740  hypothetical protein  28.19 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.088558  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0650  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.33 
 
 		 288 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>