18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5248 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5248  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  315  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  0.102471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4061  hypothetical protein  43.62 
 
 		 160 aa  136  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4620  hypothetical protein  44 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5507  hypothetical protein  37.16 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0500016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3524  hypothetical protein  38.19 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3597  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  38.19 
 
 		 157 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3529  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12072  hypothetical protein  34.42 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3929  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.67 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.514599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2800  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.17 
 
 		 269 aa  87.8  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000207349  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0166  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.25 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.177176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0175  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.24 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2045  hypothetical protein  31.94 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.388066  hitchhiker  0.00198643 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0740  hypothetical protein  32.17 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.088558  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0864  hypothetical protein  32.58 
 
 		 193 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5808  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  30.47 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.640792  normal  0.646954 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2508  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.47 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0650  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.71 
 
 		 288 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>