12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6131 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6131  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  153  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0823462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4276  hypothetical protein  50.82 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4937  hypothetical protein  52.63 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0968098  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2056  hypothetical protein  40.62 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3450  hypothetical protein  44.19 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0951964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6286  hypothetical protein  43.18 
 
 		 245 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3779  hypothetical protein  40.62 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1105  hypothetical protein  47.62 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3800  hypothetical protein  37.5 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2546  hypothetical protein  35.29 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.256304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2522  hypothetical protein  35.06 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4254  hypothetical protein  36.54 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319334  normal  0.900273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>