27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1959 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1959  urease accessory protein UreE  100 
 
 		 181 aa  351  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1354  urease accessory protein UreE  61.81 
 
 		 154 aa  169  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1194  urease accessory protein UreE  60.42 
 
 		 152 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.102574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1133  urease accessory protein UreE  57.89 
 
 		 153 aa  165  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.657997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6192  urease accessory protein UreE  55.26 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0865058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4445  urease accessory protein UreE  41.96 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2200  urease accessory protein UreE  38.57 
 
 		 146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178032  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2413  urease accessory protein UreE, putative  38.57 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1554  urease accessory protein UreE  29.63 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2770  urease accessory protein UreE  35.56 
 
 		 149 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5117  UreE urease accessory domain protein  26.99 
 
 		 217 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1872  urease accessory protein UreE  26.42 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.525066  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0060  UreE urease accessory domain protein  34.82 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.184655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0244  urease accessory protein UreE  28.47 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1304  UreE urease accessory domain-containing protein  29.1 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2315  urease accessory protein UreE  27.36 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.6958  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2010  UreE urease accessory domain protein  28.76 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1466  UreE urease accessory domain protein  29.1 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2358  urease accessory protein UreE  27.36 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2183  urease accessory protein UreE  29.58 
 
 		 208 aa  44.3  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.173912 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2031  urease accessory protein UreE  30.6 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.889642  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1860  urease accessory protein UreE  29.58 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.326188 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0476  urease accessory protein UreE  24.74 
 
 		 149 aa  42  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0393  urease accessory protein UreE  28.97 
 
 		 161 aa  42  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2121  UreE urease accessory domain-containing protein  28.77 
 
 		 163 aa  41.6  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13555  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0832  urease accessory protein UreE  27.27 
 
 		 149 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3695  urease accessory protein UreE  27.34 
 
 		 225 aa  41.2  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.574393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>