33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1904 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1904    100 
 
 		 396 bp  785    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  88.07 
 
 		 924 bp  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  89.1 
 
 		 930 bp  349  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  89.58 
 
 		 873 bp  111  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  88.1 
 
 		 873 bp  87.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  88.1 
 
 		 873 bp  87.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  88.1 
 
 		 873 bp  87.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  88.1 
 
 		 873 bp  87.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  84.62 
 
 		 939 bp  79.8  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1042  hypothetical protein  86.9 
 
 		 546 bp  79.8  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  84.38 
 
 		 855 bp  71.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5317  integrase catalytic region  83.33 
 
 		 921 bp  67.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0707814  normal  0.862383 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3070    86.3 
 
 		 691 bp  65.9  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817214  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1092    83.33 
 
 		 860 bp  63.9  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0607  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 702 bp  60  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1549  Integrase catalytic region  91.11 
 
 		 810 bp  58  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1497    86.15 
 
 		 2972 bp  58  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  82.56 
 
 		 930 bp  52  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  82.56 
 
 		 930 bp  52  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  82.56 
 
 		 930 bp  52  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  81.37 
 
 		 1182 bp  52  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1903    100 
 
 		 183 bp  52  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.224169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  90.24 
 
 		 783 bp  50.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1458    90.24 
 
 		 867 bp  50.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7887    86.79 
 
 		 637 bp  50.1  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  81.52 
 
 		 810 bp  48.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  81.52 
 
 		 810 bp  48.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2509  integrase  81.52 
 
 		 696 bp  48.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0263754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  81.52 
 
 		 810 bp  48.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  81.52 
 
 		 810 bp  48.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4471  integrase catalytic region  81.82 
 
 		 708 bp  48.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154485  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  83.82 
 
 		 930 bp  48.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1183    100 
 
 		 827 bp  46.1  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>