20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1050 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1050  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  907    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0639  hypothetical protein  56.8 
 
 
429 aa  481  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3388  hypothetical protein  52.83 
 
 
439 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4986  hypothetical protein  52.97 
 
 
450 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0380  hypothetical protein  51.31 
 
 
450 aa  423  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0436  hypothetical protein  51.31 
 
 
450 aa  423  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.281962  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3931  hypothetical protein  51.95 
 
 
482 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0799  hypothetical protein  52.97 
 
 
479 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0295702 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1966  hypothetical protein  44.34 
 
 
447 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519588  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0146  hypothetical protein  44.31 
 
 
425 aa  339  7e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0162  hypothetical protein  40.52 
 
 
429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00501081 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1684  hypothetical protein  40.81 
 
 
430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0089  hypothetical protein  38.07 
 
 
443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.685603  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1300  hypothetical protein  34.98 
 
 
422 aa  263  4.999999999999999e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0137  aminopeptidase domain-containing protein  31.43 
 
 
412 aa  246  8e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000000072892 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1487  hypothetical protein  33.01 
 
 
438 aa  236  8e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0427  hypothetical protein  33.58 
 
 
435 aa  236  9e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1312  hypothetical protein  37.77 
 
 
252 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.426965  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13451  hypothetical protein  26.47 
 
 
434 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1313  hypothetical protein  24.86 
 
 
179 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.648233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>