48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0555 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0555  NADH dehydrogenase  100 
 
 
132 aa  277  4e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000087567  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1726  NADH dehydrogenase  61.54 
 
 
132 aa  177  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0317452  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1784  NADH dehydrogenase  60 
 
 
132 aa  177  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795414  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0902  NADH dehydrogenase  60.45 
 
 
136 aa  177  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.188118  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0898  NADH dehydrogenase  60.45 
 
 
136 aa  177  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1531  NADH dehydrogenase  60.77 
 
 
132 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91354  normal  0.684838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1719  NADH dehydrogenase  58.46 
 
 
132 aa  174  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.89803  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2277  NADH dehydrogenase  58.96 
 
 
136 aa  172  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68706  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0948  NADH dehydrogenase  61.72 
 
 
131 aa  171  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.15048 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3297  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  54.96 
 
 
132 aa  150  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223243  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1952  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit  53.85 
 
 
133 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1809  NADH dehydrogenase  51.49 
 
 
145 aa  139  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0186  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  51.91 
 
 
133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.339741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2418  NADH dehydrogenase  48.51 
 
 
140 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.211184  normal  0.0219307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1760  NADH dehydrogenase  50 
 
 
163 aa  135  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00569729  normal  0.0708647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4231  NADH dehydrogenase  50 
 
 
136 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794715  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2555  NADH dehydrogenase  48.03 
 
 
127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.645895  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3032  NADH dehydrogenase  48.51 
 
 
136 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219473  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2888  NADH dehydrogenase  47.41 
 
 
136 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000596666  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3494  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  51.15 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18453  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0304  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit  46.92 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1450  NADH dehydrogenase  52.34 
 
 
124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6039  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  47.69 
 
 
138 aa  123  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0258957  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2699  NADH dehydrogenase  45.52 
 
 
136 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0192711  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1230  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  44.7 
 
 
138 aa  122  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.168014  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1101  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  44.7 
 
 
170 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1828  NADH dehydrogenase  50 
 
 
124 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2561  NADH dehydrogenase  46.21 
 
 
136 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0195  NADH dehydrogenase  50 
 
 
124 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.2391  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0296  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit  46.15 
 
 
138 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.511676  decreased coverage  0.000705293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1036  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  45.38 
 
 
138 aa  120  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2720  NADH dehydrogenase  45.8 
 
 
125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.318843  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1267  NADH dehydrogenase  49.22 
 
 
124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1522  NADH dehydrogenase  45.67 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.417533 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1390  NADH dehydrogenase  45.31 
 
 
144 aa  110  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.450326  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2293  NADH dehydrogenase  41.73 
 
 
128 aa  110  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1262  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit  42.03 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0898564  hitchhiker  0.00141784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0824  NADH dehydrogenase  38.06 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0170  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit  41.23 
 
 
162 aa  86.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2440  NADH dehydrogenase  39.17 
 
 
118 aa  86.3  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1111  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  40.83 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.142047  normal  0.22432 
 
 
-
 
NC_002978  WD1106  hypothetical protein  36.36 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.247743  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0124  putative NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2kD subunit  34.65 
 
 
99 aa  62.8  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.571219  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03960  conserved hypothetical protein  40.86 
 
 
144 aa  62  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0184  NADH:ubiquinone oxidoreductase family protein  29.59 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02260  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B17.2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06540)  33.33 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.634001 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40699  predicted protein  42.86 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.323307  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44890  NADH:ubiquinone oxidoreductase, B17.2 subunit  30.17 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237867  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>