41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_44890 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_44890  NADH:ubiquinone oxidoreductase, B17.2 subunit  100 
 
 		 142 aa  294  2e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237867  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02260  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B17.2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06540)  43.17 
 
 		 136 aa  113  8.999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.634001 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03960  conserved hypothetical protein  35.46 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0296  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit  37.23 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.511676  decreased coverage  0.000705293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0304  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit  34.65 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1719  NADH dehydrogenase  36.52 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.89803  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1036  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  35.79 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1784  NADH dehydrogenase  35.65 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795414  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6039  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  35.11 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0258957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4231  NADH dehydrogenase  36.17 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1267  NADH dehydrogenase  37.61 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1101  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  34.74 
 
 		 170 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1230  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  34.74 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.168014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3297  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  39.13 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2440  NADH dehydrogenase  37.5 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1106  hypothetical protein  32.04 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.247743  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0186  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  34.19 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.339741 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1531  NADH dehydrogenase  36.05 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91354  normal  0.684838 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0555  NADH dehydrogenase  30.17 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000087567  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0184  NADH:ubiquinone oxidoreductase family protein  37.93 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2888  NADH dehydrogenase  34.04 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000596666  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3494  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  31.91 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18453  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2277  NADH dehydrogenase  32.98 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68706  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0170  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit  33.7 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0898  NADH dehydrogenase  31.13 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0902  NADH dehydrogenase  31.13 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.188118  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2418  NADH dehydrogenase  34.04 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.211184  normal  0.0219307 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0948  NADH dehydrogenase  34.07 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.15048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3032  NADH dehydrogenase  34.04 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2555  NADH dehydrogenase  37.21 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.645895  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1726  NADH dehydrogenase  34.88 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0317452  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0124  putative NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2kD subunit  35.63 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.571219  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2561  NADH dehydrogenase  31.73 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1450  NADH dehydrogenase  33.33 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1809  NADH dehydrogenase  31.91 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1262  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit  32.58 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0898564  hitchhiker  0.00141784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1390  NADH dehydrogenase  32.46 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.450326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2699  NADH dehydrogenase  34.04 
 
 		 136 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0192711  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2293  NADH dehydrogenase  34.88 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1522  NADH dehydrogenase  31.3 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.417533 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2720  NADH dehydrogenase  33.03 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.318843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>