50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1531 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1531  NADH dehydrogenase  100 
 
 
132 aa  273  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91354  normal  0.684838 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1726  NADH dehydrogenase  95.45 
 
 
132 aa  262  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0317452  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1784  NADH dehydrogenase  77.27 
 
 
132 aa  216  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795414  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0948  NADH dehydrogenase  75.78 
 
 
131 aa  201  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.15048 
 
 
-
 
NC_004310  BR0902  NADH dehydrogenase  70.59 
 
 
136 aa  200  6e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.188118  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0898  NADH dehydrogenase  70.59 
 
 
136 aa  200  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2277  NADH dehydrogenase  68.38 
 
 
136 aa  197  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68706  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1719  NADH dehydrogenase  67.18 
 
 
132 aa  191  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.89803  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0555  NADH dehydrogenase  60.77 
 
 
132 aa  175  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000087567  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1809  NADH dehydrogenase  59.56 
 
 
145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3494  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  61.94 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18453  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3297  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  58.14 
 
 
132 aa  157  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223243  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2418  NADH dehydrogenase  54.89 
 
 
140 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.211184  normal  0.0219307 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2888  NADH dehydrogenase  54.14 
 
 
136 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000596666  normal  0.0493854 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1760  NADH dehydrogenase  55.15 
 
 
163 aa  153  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00569729  normal  0.0708647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1952  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit  53.85 
 
 
133 aa  151  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.276225  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3032  NADH dehydrogenase  54.14 
 
 
136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.219473  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4231  NADH dehydrogenase  54.41 
 
 
136 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794715  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0186  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  52.34 
 
 
133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.339741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2699  NADH dehydrogenase  51.52 
 
 
136 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0192711  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0304  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit  54.89 
 
 
138 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1036  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  52.24 
 
 
138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1101  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  51.49 
 
 
170 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1230  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  51.49 
 
 
138 aa  137  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.168014  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0296  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit  52.99 
 
 
138 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.511676  decreased coverage  0.000705293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2555  NADH dehydrogenase  48.82 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.645895  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6039  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  50 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0258957  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1262  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit  48.53 
 
 
138 aa  127  7.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0898564  hitchhiker  0.00141784 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1267  NADH dehydrogenase  49.23 
 
 
124 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2293  NADH dehydrogenase  44.96 
 
 
128 aa  116  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2561  NADH dehydrogenase  44.62 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2720  NADH dehydrogenase  47.69 
 
 
125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.318843  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1450  NADH dehydrogenase  46.09 
 
 
124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1390  NADH dehydrogenase  42.19 
 
 
144 aa  110  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.450326  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0195  NADH dehydrogenase  45.31 
 
 
124 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.2391  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1828  NADH dehydrogenase  45.31 
 
 
124 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1522  NADH dehydrogenase  43.08 
 
 
128 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.417533 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2440  NADH dehydrogenase  44.17 
 
 
118 aa  97.1  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0170  NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit  46.55 
 
 
162 aa  96.7  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0824  NADH dehydrogenase  39.55 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1111  NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2 kD subunit  44.26 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.142047  normal  0.22432 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0184  NADH:ubiquinone oxidoreductase family protein  38.14 
 
 
97 aa  68.6  0.00000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1106  hypothetical protein  37.96 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.247743  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0124  putative NADH:ubiquinone oxidoreductase 17.2kD subunit  36.36 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.571219  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02260  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B17.2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06540)  36.36 
 
 
136 aa  60.8  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.634001 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40699  predicted protein  49.21 
 
 
120 aa  56.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.323307  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03960  conserved hypothetical protein  34.88 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44890  NADH:ubiquinone oxidoreductase, B17.2 subunit  36.05 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237867  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34392  predicted protein  39.13 
 
 
219 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.736354  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0528  hypothetical protein  36.11 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>