21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09510 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_36140  FOG transposase  98.66 
 
 		 1206 bp  2226    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09510    100 
 
 		 1188 bp  2355    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36170    90.37 
 
 		 207 bp  228  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8497    90.36 
 
 		 555 bp  101  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6861  transposase  78.74 
 
 		 1209 bp  93.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0279    81.18 
 
 		 1215 bp  91.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0831    87.95 
 
 		 258 bp  85.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.280807  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6341    87.06 
 
 		 367 bp  81.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0162    80.26 
 
 		 557 bp  63.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1737    85.71 
 
 		 2420 bp  60  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.460985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2731  transposase IS701  85.71 
 
 		 1251 bp  60  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2323  transposase IS701  85.71 
 
 		 1251 bp  60  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.564706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1738  transposase IS701  85.71 
 
 		 1251 bp  60  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1727  transposase IS701  85.71 
 
 		 1251 bp  60  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1257    85.71 
 
 		 2455 bp  60  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0467  transposase IS701  85.71 
 
 		 1251 bp  60  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.529272  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3787    83.33 
 
 		 351 bp  56  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.283893  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3063    92.5 
 
 		 759 bp  56  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.977353  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5626  transposase  88.89 
 
 		 1254 bp  54  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35278 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0390  transposase  89.36 
 
 		 363 bp  54  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.952512  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2617    81.25 
 
 		 396 bp  48.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.91328 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>