24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_03100 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_03100  TM2 domain-containing hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  261  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4145  TM2 domain-containing protein  86.36 
 
 		 132 aa  236  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5043  hypothetical protein  79.84 
 
 		 184 aa  228  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0480  TM2  78.29 
 
 		 134 aa  221  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5091  hypothetical protein  79.55 
 
 		 139 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0374  TM2 domain-containing protein  80.47 
 
 		 139 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4964  TM2 domain-containing protein  79.55 
 
 		 139 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5316  TM2  76.92 
 
 		 144 aa  217  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5141  TM2 domain-containing protein  79.84 
 
 		 139 aa  216  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0167  TM2 domain-containing protein  80.47 
 
 		 135 aa  214  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05210  hypothetical protein  76.15 
 
 		 134 aa  208  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0498  hypothetical protein  74.62 
 
 		 134 aa  206  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1993  TM2 domain-containing protein  70.77 
 
 		 135 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0383529  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0299  TM2 domain containing protein  70.23 
 
 		 135 aa  197  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000251621  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2502  TM2  80.3 
 
 		 140 aa  196  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000265771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1622  hypothetical protein  71.88 
 
 		 132 aa  191  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4937  TM2 domain containing protein  45.45 
 
 		 194 aa  67  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2399  TM2 domain-containing protein  52.38 
 
 		 169 aa  63.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324538  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0479  TM2 domain-containing protein  45.35 
 
 		 114 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1825  TM2 domain containing protein  48.21 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4957  TM2  39.74 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  51.43 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2261  TM2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 103 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46379  normal  0.197019 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  38.36 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>