52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_02290 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_02290  clp protease  100 
 
 		 142 aa  298  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2263  peptidase S14, ClpP  73.24 
 
 		 183 aa  223  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168754  normal  0.0339851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2643  peptidase S14 ClpP  69.72 
 
 		 183 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00556113  normal  0.503778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3267  Clp protease, putative  68.31 
 
 		 198 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2493  peptidase S14, ClpP  68.31 
 
 		 183 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3110  hypothetical protein  68.31 
 
 		 184 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00654762  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36350  hypothetical protein  68.31 
 
 		 184 aa  209  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0193577  normal  0.867285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2629  peptidase S14 ClpP  65.49 
 
 		 183 aa  203  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.358481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25250  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  32.03 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0560465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28390  protease subunit of ATP-dependent protease  29.13 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  28.35 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1568  Endopeptidase Clp  27.69 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.463332  normal  0.0340848 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4258  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.77 
 
 		 240 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621412  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15461  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.13 
 
 		 197 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.614772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  27.13 
 
 		 203 aa  43.9  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3651  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.78 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5312  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.56 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0232  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.56 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.798089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5270  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.56 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.491278  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.78 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.117643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5687  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.56 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5236  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.56 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0203  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.56 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3578  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.78 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1059  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.48 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.027363  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4844  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.56 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4829  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.56 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5254  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.56 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2388  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.35 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3694  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.56 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2052  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.24 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.913784  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5000  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.56 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2588  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  29.69 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.56 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4040  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  33.78 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4944  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  27.56 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09663  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  30.77 
 
 		 182 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.409617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0810  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.77 
 
 		 194 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.883413  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0709  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  26.56 
 
 		 195 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2511  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.35 
 
 		 202 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1845  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  26.15 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000342072  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  27.27 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1531  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  37.5 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.307133  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  25.98 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2537  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.91 
 
 		 199 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4985  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  29.13 
 
 		 207 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935151  normal  0.656558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3437  peptidase S14 ClpP  28.23 
 
 		 345 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3477  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  26.56 
 
 		 195 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  25.58 
 
 		 214 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1459  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  28.35 
 
 		 202 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12486  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  32.31 
 
 		 200 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1393  Endopeptidase Clp  27.69 
 
 		 206 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.849713  normal  0.771731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>