16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01720 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_01720  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  245  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50420  hypothetical membrane protein  67.69 
 
 
130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00570  hypothetical protein  56.59 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50410  hypothetical membrane protein  45.45 
 
 
134 aa  100  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00560  hypothetical protein  66.32 
 
 
102 aa  97.1  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38580  hypothetical protein  53.15 
 
 
128 aa  94  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04580  hypothetical protein  53.64 
 
 
129 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33410  hypothetical protein  52.73 
 
 
129 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32050  hypothetical protein  51.82 
 
 
129 aa  88.6  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35450  hypothetical protein  50.47 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1917  hypothetical protein  35.71 
 
 
119 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21050  hypothetical protein  58.93 
 
 
85 aa  58.9  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2238  hypothetical protein  39.09 
 
 
115 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.644724  normal  0.786116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28060  hypothetical protein  54.17 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3033  hypothetical protein  41.96 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2123  OmpA/MotB domain-containing protein  31.87 
 
 
238 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0746803  normal  0.0463791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>