14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_50410 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_50410  hypothetical membrane protein  100 
 
 
134 aa  262  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00570  hypothetical protein  58.87 
 
 
132 aa  141  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01720  hypothetical protein  45.45 
 
 
126 aa  100  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38580  hypothetical protein  52.21 
 
 
128 aa  99  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04580  hypothetical protein  49.56 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33410  hypothetical protein  48.67 
 
 
129 aa  93.6  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32050  hypothetical protein  46.02 
 
 
129 aa  87  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50420  hypothetical membrane protein  42.73 
 
 
130 aa  84  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35450  hypothetical protein  46.15 
 
 
200 aa  76.6  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00560  hypothetical protein  47.87 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28060  hypothetical protein  51.35 
 
 
90 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2238  hypothetical protein  36.7 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.644724  normal  0.786116 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1917  hypothetical protein  28.07 
 
 
119 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21050  hypothetical protein  80.65 
 
 
85 aa  50.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>