15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2238 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2238  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  228  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.644724  normal  0.786116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3033  hypothetical protein  65.22 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1917  hypothetical protein  41.44 
 
 		 119 aa  87  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00570  hypothetical protein  42.34 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38580  hypothetical protein  43.52 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50420  hypothetical membrane protein  46.07 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50410  hypothetical membrane protein  36.7 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01720  hypothetical protein  39.09 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32050  hypothetical protein  40.37 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33410  hypothetical protein  39.45 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04580  hypothetical protein  39.45 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35450  hypothetical protein  39 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28060  hypothetical protein  46.67 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31780  hypothetical protein  41.51 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00560  hypothetical protein  34.38 
 
 		 102 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>