15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1917 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1917  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  231  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00570  hypothetical protein  42.11 
 
 		 132 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01720  hypothetical protein  35.71 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50420  hypothetical membrane protein  40 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227487  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2238  hypothetical protein  41.44 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.644724  normal  0.786116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38580  hypothetical protein  42.61 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32050  hypothetical protein  43.93 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04580  hypothetical protein  44.86 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33410  hypothetical protein  43.93 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35450  hypothetical protein  44.9 
 
 		 200 aa  57.4  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3033  hypothetical protein  40.35 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50410  hypothetical membrane protein  28.07 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2123  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0746803  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28060  hypothetical protein  43.84 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2517  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 249 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0742352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>