15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3033 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3033  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  235  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2238  hypothetical protein  65.22 
 
 
115 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.644724  normal  0.786116 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1917  hypothetical protein  40.35 
 
 
119 aa  92.8  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00570  hypothetical protein  43.52 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01720  hypothetical protein  38.74 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50420  hypothetical membrane protein  41.44 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38580  hypothetical protein  44.35 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32050  hypothetical protein  45.74 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50410  hypothetical membrane protein  35.71 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04580  hypothetical protein  41.74 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33410  hypothetical protein  40.87 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35450  hypothetical protein  42 
 
 
200 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28060  hypothetical protein  47.89 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00560  hypothetical protein  42.42 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2004  OmpA family protein  34.21 
 
 
240 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.200966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>