13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_00560 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_00560  hypothetical protein  100 
 
 
102 aa  196  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01720  hypothetical protein  66.32 
 
 
126 aa  121  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50420  hypothetical membrane protein  67.11 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00570  hypothetical protein  54.74 
 
 
132 aa  104  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50410  hypothetical membrane protein  47.87 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38580  hypothetical protein  49.47 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04580  hypothetical protein  48.42 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32050  hypothetical protein  48.42 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33410  hypothetical protein  46.32 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21050  hypothetical protein  66.07 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35450  hypothetical protein  46.32 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1917  hypothetical protein  30.21 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2517  OmpA/MotB domain-containing protein  40.58 
 
 
249 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0742352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>