15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_28060 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_28060  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  182  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33410  hypothetical protein  98.89 
 
 
129 aa  181  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04580  hypothetical protein  97.78 
 
 
129 aa  158  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32050  hypothetical protein  89.77 
 
 
129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38580  hypothetical protein  80.9 
 
 
128 aa  133  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00570  hypothetical protein  70.27 
 
 
132 aa  107  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35450  hypothetical protein  95.45 
 
 
200 aa  103  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50410  hypothetical membrane protein  51.35 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50420  hypothetical membrane protein  56.94 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01720  hypothetical protein  50 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00560  hypothetical protein  53.57 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31780  hypothetical protein  52.83 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1917  hypothetical protein  43.84 
 
 
119 aa  52.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2238  hypothetical protein  46.67 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.644724  normal  0.786116 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3033  hypothetical protein  50 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>