16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_04580 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_04580  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  258  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33410  hypothetical protein  98.45 
 
 
129 aa  256  9e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32050  hypothetical protein  88.98 
 
 
129 aa  211  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38580  hypothetical protein  82.03 
 
 
128 aa  195  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35450  hypothetical protein  96.19 
 
 
200 aa  178  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00570  hypothetical protein  71.68 
 
 
132 aa  166  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28060  hypothetical protein  97.78 
 
 
90 aa  159  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01720  hypothetical protein  50.41 
 
 
126 aa  113  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50410  hypothetical membrane protein  49.56 
 
 
134 aa  110  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50420  hypothetical membrane protein  54.95 
 
 
130 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00560  hypothetical protein  48.42 
 
 
102 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1917  hypothetical protein  41.23 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31780  hypothetical protein  52.83 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2238  hypothetical protein  39.29 
 
 
115 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.644724  normal  0.786116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21050  hypothetical protein  44.44 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3033  hypothetical protein  50 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>